结论：法院是否同意减免3万利息，并非仅由申请执行人同意决定，而是需要综合考虑多种因素，包括借款合同的具体条款、利息的计算方式是否合法、双方协商的情况以及法院的自由裁量权等。

分析：

1. 借款合同的具体条款：

   • 首先，需要审查借款合同中关于利息的约定。如果合同中明确规定了利息的计算方式和金额，且该约定不违反法律法规的强制性规定，那么法院在判决时通常会尊重合同约定。
   • 如果合同中的利息约定存在模糊或不明确之处，或者利息计算方式违反了法律法规（如超过了法定利率上限），那么法院可能会根据实际情况进行调整。

2. 利息的计算方式是否合法：

   • 根据《最高人民法院关于审理民间借贷案件适用法律若干问题的规定》，民间借贷的利率有明确的上限规定。如果借款合同中的利息超过了法定上限，超出部分的利息将不被法院支持。
   • 在您的情况下，如果原始的利息计算（即3万利息相对于5万本金）已经超过了法定利率上限，那么即使申请执行人同意减免部分利息，法院也可能只会认可合法范围内的利息减免。

3. 双方协商的情况：

   • 申请执行人同意减免利息是一种自愿行为，体现了双方的和解意愿。然而，这种和解意愿需要得到法院的认可才能具有法律效力。
   • 法院在审查双方协商情况时，会考虑协商过程是否公平、自愿，以及是否损害了其他债权人的利益等因素。

4. 法院的自由裁量权：

   • 在处理民间借贷纠纷时，法院拥有一定的自由裁量权。这意味着法院可以根据案件的具体情况，包括借款人的还款能力、借款用途、双方的经济状况等因素，对利息的减免进行合理判断。
   • 因此，即使申请执行人同意减免利息，法院也可能根据案件实际情况做出不同的裁决。

建议：

• 如果您是借款人，且希望法院认可利息的减免，建议您积极与申请执行人协商，并达成书面和解协议。同时，准备好相关证据（如借款合同、还款记录等）以支持您的主张。
• 如果您是申请执行人，且同意减免利息，也建议您与借款人达成书面和解协议，并明确减免的具体金额和条件。这样有助于增加法院认可减免的可能性。
• 无论您是借款人还是申请执行人，都建议在协商过程中咨询专业律师的意见，以确保您的权益得到充分保障。

最终说明：法院是否同意减免利息是一个复杂的问题，需要综合考虑多种因素。如果您对此有进一步的疑问或需要具体的法律帮助，请直接向我咨询。