利息减免和申请执行人达成协议后，法院是否认可，这主要取决于协议的具体内容、达成协议的程序以及是否符合相关法律法规的规定。以下从几个方面进行详细分析：

1. 协议内容的合法性：

   • 利息减免协议必须基于双方自愿、平等、公平的原则达成，且内容不得违反法律、行政法规的强制性规定。例如，如果减免的利息部分原本就属于非法高利，那么这部分利息的减免是合法的，但如果是合法利息的减免，则需要双方协商一致，并确保不损害国家、集体或第三人的利益。
   • 协议中应明确减免的利息金额、减免后的还款金额、还款期限等关键条款，以确保协议的明确性和可执行性。

2. 达成协议的程序：

   • 双方应在执行过程中或执行前，通过协商、调解等方式达成利息减免协议。如果是在执行过程中达成，通常需要向法院提交书面协议，并由法院进行审查确认。
   • 法院在审查协议时，会关注协议是否双方真实意思表示、是否损害他人利益、是否违反法律法规等。如果协议符合这些要求，法院通常会予以认可，并据此作出相应的执行裁定或调解书。

3. 法院的认可与执行：

   • 一旦法院认可了利息减免协议，该协议就具有了法律效力，双方必须按照协议内容履行义务。如果一方不履行，另一方可以向法院申请强制执行。
   • 法院在执行过程中，会依据认可的协议内容，对被执行人的财产进行查封、扣押、冻结等措施，以确保申请执行人的权益得到实现。

4. 特殊情况下的处理：

   • 如果利息减免协议是在被执行人面临严重经济困难、无法按时履行还款义务的情况下达成的，且协议内容合理、公平，法院通常会给予更多的支持和认可。
   • 如果协议存在欺诈、胁迫等情形，或者损害了国家、集体或第三人的利益，法院将不予认可，并可能依法撤销或变更协议内容。

建议：

• 在达成利息减免协议前，双方应充分了解相关法律法规和政策规定，确保协议内容的合法性和有效性。
• 协议达成后，应及时向法院提交书面协议，并积极配合法院的审查确认工作。
• 如果在执行过程中遇到任何问题或争议，应及时向法院反映并寻求帮助。

如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。