经济补偿金并不是扣自己的工资，而是由用人单位根据法律规定支付给劳动者的补偿。下面我将从多个角度为你详细解释这个问题：
经济补偿金的来源与性质：
- 经济补偿金是用人单位在解除或终止劳动合同时，依法支付给劳动者的一次性补偿。
- 它的来源是用人单位的自有资金，而不是从劳动者的工资中扣除。
经济补偿金的计算基数：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法实施条例》第二十七条的规定，经济补偿金的计算基数是劳动者的应发工资，而非实发工资。
- 应发工资包括计时工资或计件工资，以及奖金、津贴、补贴等所有货币性收入，是劳动者理论上应该获得的全部收入。
- 实发工资则是劳动者实际拿到手的工资，它是在应发工资的基础上扣除了如个人所得税、社会保险费个人缴纳部分等各类应由个人承担的费用后的金额。
经济补偿金的支付条件与标准：
- 经济补偿金的支付通常与劳动合同的解除或终止相关，如用人单位提出解除劳动合同、劳动合同到期不续签等情形。
- 支付标准根据劳动者在本单位的工作年限确定，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。
- 如果劳动者月工资高于用人单位所在直辖市、设区的市级人民政府公布的本地区上年度职工月平均工资三倍的，支付经济补偿的标准按职工月平均工资三倍的数额支付，且支付经济补偿的年限最高不超过十二年。
特殊情况下的经济补偿金计算：
- 如果劳动者在劳动合同解除或终止前12个月的平均工资低于当地最低工资标准，那么经济补偿金的计算将按照当地最低工资标准进行。
- 如果劳动者工作不满12个月，则按照实际工作的月数来计算平均工资，并以此为基础计算经济补偿金。
举例说明：
假设某劳动者在用人单位工作了3年，月应发工资为5000元（包括基本工资、奖金等所有货币性收入），在劳动合同解除时，用人单位应支付的经济补偿金为：5000元/月 × 3月 = 15000元。这个金额并不是从劳动者之前的工资中扣除的，而是由用人单位额外支付的。
总结与建议：
- 经济补偿金是用人单位依法支付给劳动者的补偿，不是从劳动者工资中扣除的。
- 劳动者在了解自己的权益时，应明确经济补偿金的计算基数和支付标准。
- 如果用人单位未依法支付经济补偿金，劳动者可以通过法律途径维护自己的合法权益。
如果你对经济补偿金还有其他疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。