在计算经济补偿时，年均工资通常是扣除个人缴纳部分（如社保、公积金等）后的实发工资或应发工资的平均值，但具体计算方式可能因地区和具体规定而有所不同，不过一般实践中多以应发工资为计算基数，且该基数会扣除个人缴纳部分后的净额来考量实际收入情况对经济补偿的影响。以下是对这一问题的详细分析：

一、经济补偿的计算基数

经济补偿的计算基数一般是劳动者在劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资。这个平均工资的计算，理论上应包含劳动者应得的全部工资性收入，但实际操作中，会考虑到个人缴纳部分（如社保、公积金等）的扣除情况。

1. 应发工资与实发工资：

   • 应发工资：即劳动者在提供正常劳动情况下，用人单位应当支付给劳动者的工资总额，包括基本工资、奖金、津贴、补贴等。
   • 实发工资：即劳动者实际收到的工资，是应发工资扣除个人缴纳的社保、公积金等费用后的净额。

2. 计算基数的确定：

   • 在计算经济补偿时，一般以应发工资为计算基数，但会考虑到个人缴纳部分的扣除。也就是说，虽然计算基数是应发工资，但在实际计算经济补偿时，会考虑到劳动者实际到手的收入情况。
   • 某些地区或特定情况下，可能直接以实发工资作为计算基数，但这并非普遍做法，且可能因地区和具体规定而有所不同。

二、个人缴纳部分的处理

在计算经济补偿时，个人缴纳部分（如社保、公积金等）的处理方式可能因地区和具体规定而有所不同。但一般而言，这些费用是从劳动者的应发工资中扣除的，因此在计算经济补偿时，实际上已经考虑了这些扣除因素。

1. 社保与公积金的扣除：

   • 社保和公积金是劳动者和用人单位共同缴纳的费用，其中个人缴纳部分是从劳动者的工资中扣除的。
   • 在计算经济补偿时，虽然计算基数是应发工资，但劳动者实际到手的收入（即实发工资）已经扣除了这些费用。

2. 经济补偿的计算：

   • 经济补偿的计算公式一般为：经济补偿=工作年限×月平均工资。
   • 月平均工资的计算，理论上应包含劳动者应得的全部工资性收入，但实际操作中会考虑到个人缴纳部分的扣除情况。如果以应发工资为计算基数，则个人缴纳部分已在应发工资中体现，计算经济补偿时无需再次扣除；如果以实发工资为计算基数（非普遍做法），则直接以实发工资计算即可。

三、实际操作中的注意事项

1. 地区差异：不同地区对于经济补偿的计算基数和个人缴纳部分的处理方式可能有所不同。因此，在具体操作时，应参考当地的相关规定和司法实践。
2. 合同约定：如果劳动合同中有关于经济补偿的特别约定，且该约定不违反法律法规的强制性规定，则应按照合同约定执行。
3. 证据收集：在计算经济补偿时，劳动者应收集好相关证据，如工资条、社保缴纳记录等，以便在发生争议时维护自己的合法权益。

举例说明：假设某劳动者在劳动合同解除前十二个月的应发工资总额为120,000元，其中个人缴纳的社保和公积金总额为12,000元。则该劳动者的月平均工资（应发）为10,000元。在计算经济补偿时，如果以应发工资为计算基数，且不考虑其他因素（如工作年限等），则经济补偿的计算基数为10,000元（已隐含个人缴纳部分的扣除影响，因为应发工资本身已扣除个人部分前的总额概念在此处用于计算基数，实际经济补偿计算会基于这个基数但考虑的是劳动者实际收入状况对补偿的影响，而直接计算时我们仍用应发工资作为基数标准）；如果以实发工资为计算基数（非普遍情况），且该劳动者实发工资为8,800元/月（已扣除个人缴纳部分），则经济补偿的计算基数为8,800元。但通常情况下，我们会以应发工资作为计算基数，并理解这个基数已经是在考虑了个人缴纳部分后的一个综合反映（即应发工资是未扣除前的总额，但计算经济补偿时我们关注的是这个总额下劳动者实际收入状况对补偿的影响，而直接计算时以应发工资为基数是行业惯例，实际补偿金额会结合劳动者实际收入情况确定，此处为简化说明）。

总结来说，在计算经济补偿时，年均工资（即月平均工资）的计算通常考虑的是劳动者应得的全部工资性收入，但实际操作中会隐含地考虑到个人缴纳部分的扣除情况。如果对此仍有疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。