结论：公司扣留您的车辆并阻止您从事运输工作，这一行为是否合法以及您是否可以起诉公司，取决于公司扣车的具体原因和法律依据。以下从不同角度为您详细分析：
一、若公司扣车行为缺乏合法依据
公司无权擅自扣车：
- 一般情况下，公司并非执法机关，无权擅自扣留员工的个人财产，包括车辆。如果公司未经您同意，擅自扣留您的车辆，这可能构成对您的财产权的侵犯。
您可以采取的法律措施：
- 协商解决：首先，您可以尝试与公司进行协商，要求公司立即归还车辆，并解释扣车的原因。如果公司拒绝归还或无法给出合理理由，您可以考虑采取法律手段。
- 报警处理：如果公司扣车行为涉嫌违法，如盗窃、侵占等，您可以向当地公安机关报案，要求公安机关介入调查。
- 提起诉讼：如果协商和报警均无法解决问题，您可以向法院提起诉讼，要求公司归还车辆并赔偿因扣车给您造成的损失。在诉讼过程中，您需要提供相关证据证明公司扣车的违法性和给您造成的损失。
二、若公司扣车行为有合法依据（如基于劳动合同或公司规章制度）
审查劳动合同和公司规章制度：
- 您需要仔细审查与公司签订的劳动合同以及公司的规章制度，看其中是否有关于公司可以扣留员工车辆的规定。如果合同或规章制度中有明确规定，并且该规定不违反法律法规的强制性规定，那么公司扣车行为可能具有一定的合法性。
合法性审查：
- 即使合同或规章制度中有相关规定，也需要审查这些规定是否合法、合理。例如，如果规定公司可以在员工违反公司规定时扣留车辆，但并未明确具体的违反情形和扣车程序，那么该规定可能因过于模糊而缺乏可操作性，甚至可能构成对员工权益的侵犯。
您可以采取的法律措施：
- 协商变更或撤销规定：如果合同或规章制度中的规定存在不合法或不合理之处，您可以与公司协商变更或撤销这些规定。
- 提起劳动仲裁或诉讼：如果协商无果，您可以向劳动仲裁机构提起劳动仲裁，要求确认公司扣车行为的违法性，并要求公司归还车辆和赔偿损失。如果对劳动仲裁结果不满，您还可以向法院提起诉讼。
三、特殊情况下的考虑
- 车辆是否属于公司财产：如果车辆实际上属于公司财产，只是由您使用，那么公司有权在特定情况下（如您违反公司规定或合同约定）扣留车辆。但即使如此，公司也需要遵循合法的程序和规定。
- 是否存在其他纠纷：如果公司扣车行为与其他纠纷（如劳动争议、经济纠纷等）有关，那么您需要综合考虑这些纠纷的解决方式，以及它们对公司扣车行为的影响。
建议：在处理此类问题时，我建议您首先与公司进行协商，了解扣车的具体原因和依据。如果协商无果，您可以咨询专业律师（即我本人，喻燕立律师，专注于建设工程、劳动纠纷领域），获取更具体的法律建议。同时，请务必保留好相关证据，如车辆所有权证明、劳动合同、公司规章制度、扣车通知等，以便在需要时提供证明。