结论：私企设计院没有底薪、只按提成支付工资且总是预发、若干年后还欠公司的做法，一般是不合法的。以下从不同角度进行详细分析：

工资支付的基本原则

根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。这意味着，劳动者有权获得稳定且及时的工资支付，而设计院没有底薪、只按提成支付工资且预发、欠付的做法，显然违反了这一基本原则。

底薪与提成的关系

1. 底薪的必要性：底薪是劳动者提供正常劳动后应获得的基本报酬，是保障劳动者基本生活需要的必要条件。即使劳动者在某些月份没有完成提成任务，设计院也应支付底薪，以确保劳动者的基本生活不受影响。
2. 提成的性质：提成是劳动者在完成一定工作任务或达到一定业绩后，根据约定获得的额外报酬。提成可以作为工资的补充部分，但不能替代底薪。

预发工资与欠付工资的问题

1. 预发工资的合法性：预发工资本身并不违法，但前提是预发的工资不得低于当地最低工资标准，且应确保劳动者在后续月份中能够获得足额的工资支付。如果设计院预发的工资远低于劳动者应得的工资，且后续月份无法补足差额，则这种做法是不合法的。
2. 欠付工资的后果：如果设计院长期欠付劳动者工资，劳动者有权向劳动行政部门投诉，要求设计院支付欠付的工资及可能的赔偿金。同时，劳动者还可以根据《中华人民共和国劳动合同法》的规定，解除劳动合同并要求设计院支付经济补偿。

具体建议

1. 与设计院协商：劳动者可以首先尝试与设计院进行协商，要求设计院按照法律规定支付底薪和提成，并补足欠付的工资。
2. 向劳动行政部门投诉：如果协商无果，劳动者可以向当地劳动行政部门投诉，要求劳动行政部门介入调查并处理设计院的违法行为。
3. 申请劳动仲裁或提起诉讼：如果劳动行政部门的处理结果不能满足劳动者的需求，劳动者还可以申请劳动仲裁或提起诉讼，通过法律途径维护自己的合法权益。

举例说明：假设某劳动者在设计院工作，每月应得底薪为3000元，提成根据业绩浮动。但设计院每月只预发2000元工资，且多年未补足差额。在这种情况下，劳动者有权要求设计院支付欠付的底薪和提成，并可能获得相应的赔偿金。

后续行动建议：如果你或你身边的人遇到了类似的情况，建议及时收集相关证据（如工资条、劳动合同、工作记录等），并向专业律师（如我）咨询具体的法律维权策略。