结论：员工换班后法定一天上两个班是否合法，需根据具体情况判断，包括是否违反工时制度、是否支付加班费以及是否经过员工同意等因素。
分析：
工时制度：
- 根据我国《劳动法》的规定，劳动者每日工作时间不超过8小时，平均每周工作时间不超过44小时。这是标准工时制度。
- 如果一天上两个班导致工作时间超过法定标准，且未经过特殊工时制度（如综合计算工时工作制或不定时工作制）的审批，则可能构成违法。
加班费支付：
- 即使一天上两个班的工作时间在特殊工时制度下被允许，但如果超出了正常工作时间，用人单位仍需按照法律规定支付加班费。
- 加班费的支付标准根据加班时间的不同而有所差异，如工作日加班、休息日加班和法定节假日加班的支付标准均不同。
员工同意：
- 即使一天上两个班在工时制度和加班费支付上均符合法律规定，但如果未经员工同意，也可能构成违法。
- 员工有权拒绝不合理的加班要求，用人单位不得强迫或变相强迫员工加班。
具体建议：
对于用人单位：
- 应严格遵守国家关于工时制度的规定，合理安排员工的工作时间。
- 如需实行特殊工时制度，应依法向劳动行政部门申请审批。
- 加班应支付加班费，并确保加班时间不超过法定限制。
- 加班前应征得员工同意，不得强迫或变相强迫员工加班。
对于员工：
- 应了解自己的工作时间和加班权益，如发现用人单位违反法律规定，可向劳动行政部门投诉或寻求法律援助。
- 在面对加班要求时，有权根据自己的实际情况和意愿决定是否接受。
- 如因加班导致身体健康受损或其他权益受损，可依法维护自己的合法权益。
可能后果：
- 如果用人单位违反工时制度或加班费支付规定，可能面临劳动行政部门的处罚，包括警告、罚款等。
- 员工有权要求用人单位支付拖欠的加班费，并可能因此解除劳动合同并要求经济补偿。
- 在极端情况下，如因长时间加班导致员工身体健康严重受损，用人单位还可能承担民事赔偿责任甚至刑事责任。
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