单位负责人贪污单位钱款，属于严重的违法犯罪行为，应当立即采取法律措施进行应对，核心处理方式如下：
收集证据
首先，需尽可能收集与贪污行为相关的证据，包括但不限于财务记录、转账凭证、合同文件、邮件往来、聊天记录、证人证言等。证据的充分性和合法性是后续法律程序的关键，建议由专业人员协助进行证据的固定和保全。
内部处理
- 报告上级或董事会：若单位有上级管理机构或董事会，应立即向其报告，要求启动内部调查程序。
- 暂停职务：在调查期间，可建议暂停涉事负责人的职务，防止其继续实施违法行为或转移资产。
- 完善内控：同时，需审查单位内部财务管理制度，查找漏洞并完善，以防止类似事件再次发生。
- 刑事报案
贪污行为可能涉嫌《中华人民共和国刑法》中的贪污罪或职务侵占罪（具体取决于单位性质和负责人身份）。
- 贪污罪：适用于国家工作人员利用职务上的便利，侵吞、窃取、骗取公共财物的行为。
- 职务侵占罪：适用于非国家工作人员（如私营企业负责人）利用职务上的便利，将本单位财物非法占为己有的行为。
建议立即向公安机关经侦部门报案，并提交初步证据，推动刑事立案侦查。
民事追偿
在刑事程序之外，单位可通过民事诉讼要求涉事负责人返还贪污款项，并赔偿因贪污行为造成的损失。需注意，刑事判决中的退赔部分可能与民事赔偿存在交叉，需合理设计诉讼策略。
行政举报（如适用）
若单位属于特定行业（如金融、医疗等），可向相关行业监管部门举报，要求对涉事负责人及单位进行行政处罚或行业禁入。
注意事项
- 时效性：刑事追诉有追诉期限限制，需尽快行动。
- 保密性：在调查和报案过程中，注意保护关键证据和证人信息，防止涉事负责人销毁证据或威胁证人。
- 专业协助：贪污案件涉及刑事、民事、行政多领域法律问题，建议委托专业律师全程参与，确保程序合法、策略得当。
若您单位遇到此类问题，可直接向我咨询具体应对方案，我将结合案件细节提供进一步法律指导。