在买卖合同纠纷中，一般不能直接起诉公司的经营权，但可以根据合同约定或法律规定起诉与合同相关的公司主体。以下是对此问题的详细分析：

一、合同相对性原则

根据合同的相对性原则，买卖合同一般只能约束合同的双方当事人，即买方和卖方。这意味着，在一般情况下，如果发生买卖合同纠纷，原告只能起诉与其签订合同的另一方，而不能直接起诉与合同无关的公司主体，包括公司的经营权。公司的经营权并非一个独立的法律主体，而是公司作为法人所享有的一种管理权限，因此不能作为被告被起诉。

二、合同中的特别约定

然而，如果买卖合同中特别约定了可以起诉关联公司或特定公司主体，那么在这种情况下，原告可以依据合同约定起诉相关公司。这种约定通常出现在涉及复杂商业交易或多方参与的合同中，旨在扩大合同纠纷的解决范围，确保各方权益得到保障。

三、法律规定的例外情形

除了合同中的特别约定外，法律也可能规定某些例外情形，允许原告在特定情况下起诉与合同相关的非合同方公司主体。例如，如果关联公司实际参与了合同的履行或从中受益，且其参与行为与合同纠纷存在直接关联，那么原告可能有权依据相关法律规定起诉该关联公司。但这种情况较为罕见，且需要具体分析相关法律规定和案件事实。

四、实际操作建议

1. 审查合同条款：在发生买卖合同纠纷时，首先应仔细审查合同条款，特别是关于争议解决和被告确定的条款。如果合同中有特别约定可以起诉关联公司或特定公司主体，那么应依据合同约定进行起诉。

2. 咨询专业律师：如果合同中没有特别约定，且不确定是否可以起诉关联公司或特定公司主体，建议咨询专业律师。律师可以根据案件事实和法律规定，为您提供专业的法律意见和诉讼策略。

3. 准备充分证据：无论起诉合同方还是关联公司，都需要准备充分的证据来支持自己的诉讼请求。这包括合同文本、交易记录、沟通记录等。证据的充分性和真实性对于案件的胜诉至关重要。