结论：员工在交通事故中承担次要责任，公交公司是否能辞退该员工，需根据具体情况判断，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：
一、从劳动合同解除的法定条件角度
根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位解除劳动合同需符合法定条件，如员工严重违反用人单位的规章制度、严重失职或营私舞弊给用人单位造成重大损害等。在员工交通事故中承担次要责任的情况下，是否构成公交公司解除劳动合同的法定条件，需具体分析：
若交通事故未造成严重后果：如果员工在交通事故中承担次要责任，且该事故未给公交公司造成重大损害，也未严重违反公交公司的规章制度，那么公交公司通常不能以此为由辞退员工。因为此时员工的行为并未达到劳动合同法规定的解除劳动合同的严重程度。
若交通事故造成严重后果：如果员工在交通事故中承担次要责任，但该事故给公交公司造成了重大损害（如车辆严重损坏、乘客受伤等），且该损害与员工的驾驶行为有直接关系，那么公交公司可能根据劳动合同法的相关规定，以员工严重失职或给用人单位造成重大损害为由，解除与员工的劳动合同。但即便如此，公交公司也需确保解除劳动合同的程序合法，如提前通知员工、听取员工意见等。
二、从公交公司规章制度的角度
公交公司通常会有自己的规章制度，对员工的驾驶行为、事故责任等作出具体规定。如果员工在交通事故中承担次要责任，违反了公交公司的规章制度，且该规章制度是合法有效的，那么公交公司可能根据规章制度的规定，对员工进行相应的处理，包括辞退。但同样，公交公司需确保规章制度的制定程序合法、内容合理，且已向员工公示或告知。
三、从员工过错程度与公交公司管理责任的角度
在判断公交公司是否能辞退员工时，还需考虑员工的过错程度与公交公司的管理责任。如果员工在交通事故中承担次要责任，且该事故的发生与公交公司的管理、培训、监督等存在一定关系，那么公交公司在辞退员工时需更加谨慎。因为此时辞退员工可能被视为公交公司推卸管理责任的表现。
四、建议与注意事项
公交公司：在决定是否辞退员工时，应全面考虑事故的具体情况、员工的过错程度、公交公司的规章制度以及管理责任等因素。同时，应确保解除劳动合同的程序合法、合规，避免引发劳动争议。
员工：如果面临被辞退的风险，应了解自己的合法权益和公交公司的规章制度。如认为公交公司的辞退决定不合法或不合理，可以通过劳动仲裁等途径维护自己的权益。
双方沟通：在事故发生后，公交公司与员工之间应保持沟通，共同分析事故原因、总结经验教训，并协商解决方案。这有助于减少劳动争议的发生，维护双方的合法权益。
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