企业反仲裁员工多发薪资的行为，其合法性需根据具体情况来判断，不能一概而论。以下从不同角度为你详细分析：

一、合法情形

1. 双方协商一致：如果企业发现多发薪资后，与员工进行了友好协商，并且员工同意返还多发部分，那么企业可以通过仲裁或诉讼等合法途径要求员工返还。这种情况下，企业的行为是合法的，因为双方已经就薪资问题达成了新的合意。

2. 存在重大误解：根据《民法典》的相关规定，如果企业因为计算错误、系统故障等原因，导致多发薪资，且这种多发是基于重大误解的，那么企业有权要求员工返还多发部分。在这种情况下，企业可以通过仲裁或诉讼来维护自己的合法权益。

二、不合法情形

1. 无合法依据：如果企业无法证明多发薪资是由于计算错误、系统故障等合理原因导致的，或者无法证明员工存在恶意占有多发薪资的行为，那么企业单方面通过仲裁要求员工返还多发薪资可能缺乏合法依据。在这种情况下，企业的行为可能构成对员工合法权益的侵犯。

2. 违反法定程序：即使企业认为多发薪资需要返还，也必须遵循法定的程序和方式。例如，企业不能直接从员工工资中扣除多发部分，而应该先与员工协商，协商不成再通过仲裁或诉讼等途径解决。如果企业违反法定程序，擅自采取扣款等措施，那么其行为可能构成违法。

三、法律建议

1. 保留证据：无论是企业还是员工，在涉及薪资问题时都应该保留好相关证据，如工资条、转账记录、劳动合同等。这些证据在仲裁或诉讼过程中将起到至关重要的作用。

2. 友好协商：在发现多发薪资后，企业应该首先与员工进行友好协商，寻求双方都能接受的解决方案。这不仅可以避免不必要的法律纠纷，还可以维护良好的劳动关系。

3. 寻求法律帮助：如果协商不成，企业或员工都可以寻求专业的法律帮助。律师可以根据具体情况提供针对性的法律建议，帮助当事人维护自己的合法权益。

总结来说，企业反仲裁员工多发薪资的合法性取决于具体情况和法定程序。在处理这类问题时，企业应该遵循合法、公正、合理的原则，与员工进行友好协商，并在必要时寻求法律帮助。如果你在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。