结论概述：一二审判决后，双方又新签订了抚养权变更协议，起诉到法院是否会按新协议判决，这取决于多个因素，包括新协议的内容、签订背景、双方的真实意愿以及是否符合法律规定等。一般来说，如果新协议是双方真实意思的表示，且不违反法律强制性规定，法院在审理时会予以充分考虑。
详细分析：
新协议的法律效力：
- 抚养权变更协议属于民事合同范畴，其法律效力取决于双方是否具备完全民事行为能力、意思表示是否真实、内容是否合法且不违背公序良俗。
- 如果新协议是双方自愿签订，且内容合法，那么该协议在法律上是有效的，对双方具有约束力。
法院的审理原则：
- 法院在审理抚养权变更案件时，会遵循“儿童最大利益原则”，即以保障儿童的身心健康和合法权益为出发点。
- 法院会综合考虑双方的经济状况、生活环境、教育条件、与子女的感情联系等多方面因素，来评估新协议是否更有利于子女的成长。
新协议与原判决的关系：
- 如果新协议是在一二审判决后签订的，且内容与原判决不同，那么新协议实际上是对原判决的变更。
- 法院在审理时，会审查新协议是否合法、合理，以及是否更符合子女的利益。如果新协议满足这些条件，法院有可能会根据新协议作出判决。
可能的情况分析：
- 情况一：如果新协议是双方真实意思的表示，且内容合法、合理，更有利于子女的成长，那么法院很可能会按照新协议判决。
- 情况二：如果新协议存在欺诈、胁迫等情形，或者内容违法、违背公序良俗，那么法院不会按照新协议判决，而是可能维持原判决或根据实际情况作出其他判决。
- 情况三：如果新协议虽然合法，但法院认为其并不更有利于子女的成长，那么法院也可能不会完全按照新协议判决，而是会综合考虑各种因素后作出判决。
法律建议：
- 在签订抚养权变更协议前，双方应充分沟通、协商，确保协议内容真实、合法、合理。
- 协议签订后，如果一方反悔或双方产生争议，应及时寻求法律途径解决，避免对子女造成不必要的伤害。
- 在起诉到法院前，建议双方先尝试通过调解等方式解决争议，以节约诉讼成本和时间。
后续行动指导：
- 如果您已经签订了抚养权变更协议，并打算起诉到法院，请准备好相关证据材料，如协议文本、双方的身份证明、子女的相关情况等。
- 在起诉前，您可以先咨询我，我会根据您的具体情况提供更详细的法律建议和指导。
如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。