您好，关于您提出的“办理水域滩涂养殖证是否需要确定面积中有没有耕地”的问题，以下是我的详细解答：

首先，根据《水域滩涂养殖发证登记办法》的相关规定，办理水域滩涂养殖证主要关注的是水域、滩涂是否依法可以用于养殖生产，以及相关的证明材料是否合法有效、无权属争议等。该办法并未直接要求确定养殖面积中是否包含耕地。

然而，在实际操作中，特别是考虑到农业用地的管理和保护，如《玉林出台设施农业用地管理新规 严控耕地占用》这一通知所示，对于水产养殖设施用地的选址有明确要求。通知中强调，应优先利用荒山荒坡、滩涂、坑塘水面及闲置建设用地等非耕地资源，避免占用耕地，并严禁新增占用永久基本农田建设畜禽、水产养殖设施。

这意味着，在办理水域滩涂养殖证时，虽然直接的法律条文可能并未明确要求确定面积中是否包含耕地，但出于农业用地管理和保护的角度，相关部门在审核申请时，很可能会考虑养殖面积是否占用了耕地，特别是永久基本农田。如果养殖面积确实占用了耕地，那么申请人可能需要提供额外的证明材料，如县级人民政府出具的落实耕地占补平衡意见等，以满足相关管理要求。

因此，我的建议是，在办理水域滩涂养殖证时，除了准备必要的申请材料外，还应提前了解并确认养殖面积是否占用了耕地，特别是永久基本农田。如果确实占用了，应提前与相关部门沟通，了解需要提供的额外证明材料，并确保这些材料齐全、有效，以顺利办理养殖证。

希望以上解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。