企业制度变更是否必须有职工代表大会，主要取决于该制度是否直接涉及劳动者的切身利益。以下是对此问题的详细分析：
一、涉及劳动者切身利益的制度变更
法律依据：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》第四条，当用人单位制定、修改或者决定有关劳动报酬、工作时间、休息休假、劳动安全卫生、保险福利、职工培训、劳动纪律以及劳动定额管理等直接涉及劳动者切身利益的规章制度或者重大事项时，应当经职工代表大会或者全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或者职工代表平等协商确定。
实践应用：
- 在实际操作中，如果企业制度变更涉及上述直接涉及劳动者切身利益的方面，那么必须通过职工代表大会或全体职工讨论，以确保劳动者的知情权、参与权和决策权。例如，企业调整薪酬福利制度、修改劳动纪律等，都需要经过职工代表大会的审议和通过。
二、不涉及劳动者切身利益的制度变更
法律规定：
- 对于不直接涉及劳动者切身利益的企业制度，如行政管理、对外业务合作等方面的制度，法律并未强制要求必须通过职工代表大会。
企业自主权：
- 企业可以基于自身的经营管理需要，自主决定这类制度的制定流程。但前提是不违反法律法规的相关规定，且应确保制度的合法性和合理性。例如，企业可以自主决定内部行政管理流程、业务合作方式等，无需经过职工代表大会的审议。
三、特殊情况与地方法规
国家层面态度：
- 虽然国家层面没有强制要求所有企业必须建立职工代表大会，但鼓励企业通过这一形式落实民主管理，以保障劳动者的权益。
地方法规差异：
- 部分省市有更为具体的地方法规，明确要求企业或达到一定规模的企业应当建立职工代表大会制度。例如，《上海市职工代表大会条例》和《山东省企业职工代表大会条例》等均有相关规定。因此，企业在制定或变更制度时，还应关注所在地的地方法规，以确定是否有建立职工代表大会的特定要求。
四、法律建议与后果
法律建议：
- 企业在制定或变更任何规章制度时，首先应判断该制度是否直接涉及劳动者的切身利益。若涉及，则必须遵循《中华人民共和国劳动合同法》的规定，通过职工代表大会或全体职工讨论，并与工会或职工代表平等协商确定。若不涉及，企业虽可自主决定制定流程，但仍应确保制度的合法性和合理性，并尽可能保障劳动者的知情权。
法律后果：
- 如果企业未按照法律规定通过职工代表大会或全体职工讨论而直接变更涉及劳动者切身利益的制度，可能会面临劳动者的异议、投诉甚至法律诉讼。这不仅会影响企业的声誉和形象，还可能给企业带来不必要的法律风险和经济损失。
综上所述，企业制度变更是否必须有职工代表大会，主要取决于该制度是否直接涉及劳动者的切身利益。企业在制定或变更制度时，应严格遵守相关法律法规的规定，确保制度的合法性和合理性，并尽可能保障劳动者的权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。