明确结论：当员工因交通事故受伤并被认定为工伤时，即使已经获得交通事故赔付的误工费，公司仍然需要支付其停工留薪期间的工伤工资。
法律依据及原理分析
性质区别：
- 交通事故赔偿中的误工费，是基于侵权责任对受害人因交通事故所遭受损失的补偿，旨在弥补受害人因无法正常工作导致的收入减少。
- 工伤赔偿中的停工留薪期工资，则是基于劳动关系，是职工因工作原因受到事故伤害后依法享受的工伤保险待遇，用人单位有义务保障工伤职工在停工治疗期间的工资福利待遇。
相关法律规定：
- 根据《最高人民法院关于审理人身损害赔偿案件适用法律若干问题的解释》第三条，依法应当参加工伤保险统筹的用人单位的劳动者，因工伤事故遭受人身损害，应按《工伤保险条例》处理；同时，因第三人侵权造成的损害，赔偿权利人可请求第三人承担民事责任。
- 《工伤保险条例》第三十三条明确规定，职工因工作遭受事故伤害需暂停工作接受治疗的，在停工留薪期内，原工资福利待遇不变，由所在单位按月支付。
具体实践情况分析
兼得模式（双赔）：
- 在大多数情况下，除医疗费用等少数不能重复赔偿的项目外，职工可以同时获得交通事故侵权赔偿和工伤赔偿。误工费和停工留薪期工资在性质和功能上不同，不存在重复赔偿问题。前者是对交通事故导致的收入损失的赔偿，后者是用人单位对工伤职工的工资福利保障。
- 举例：职工小李上班途中发生交通事故并认定为工伤，对方负主要责任。小李在获得交通事故责任方赔付的误工费后，公司仍应按原工资福利待遇标准支付其停工留薪期工资。
特殊情况：
- 在少数地区，可能采取补充模式。若职工已从交通事故侵权方获得误工费赔偿，且该金额高于或等于职工本人工资标准，用人单位可能不再支付或补足差额部分的停工留薪期工资。但这种情况需根据当地具体法律法规确定，并非普遍现象。
法律建议
- 对于员工而言，如果因交通事故受伤并被认定为工伤，应积极主张自己的合法权益，包括要求公司支付停工留薪期工资。同时，也可以向交通事故责任方主张误工费等赔偿。
- 对于公司而言，应依法履行自己的义务，按时足额支付工伤职工的停工留薪期工资。如果因特殊情况需要调整支付方式或金额，应与员工协商一致，并确保符合当地法律法规的规定。
总结：交通事故赔付的误工费与工伤工资的支付是两个独立的法律体系下的赔偿项目，它们之间并不冲突，也不能相互替代。员工因交通事故获得的误工费赔偿，不影响其同时享受工伤保险待遇的权利。因此，即使员工已获得交通事故的误工费赔付，公司仍需按照工伤保险的规定，支付其在停工留薪期间的工伤工资。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。