企业员工与他人串通签订损害公司利益的合同，该合同一般会被认定为无效。以下从不同角度为你详细分析：

法律条款依据

根据《中华人民共和国民法典》第一百五十四条规定：“行为人与相对人恶意串通，损害他人合法权益的民事法律行为无效。”在企业员工与他人串通签订合同的场景中，员工代表公司签订合同，若其与合同相对方恶意串通，故意使合同条款对公司不利，从而损害公司的利益，这种行为完全符合上述法律条款中“恶意串通，损害他人合法权益”的情形，因此该合同自始不具有法律效力。

实际案例分析

假设某公司的采购员工与供应商恶意串通，在采购合同中约定了远高于市场价格的采购单价，并且约定了不合理的付款方式和违约责任等条款。该员工和供应商的目的就是通过这份合同让公司支付高额的采购费用，从而获取不正当利益。在这种情况下，公司发现后可以向法院起诉，要求确认该采购合同无效。法院在审理过程中，会审查员工与供应商之间是否存在恶意串通的行为，比如是否有私下交易、利益输送等证据。一旦认定存在恶意串通，就会判决该合同无效，公司无需按照合同约定支付高额费用，供应商也需要返还公司已经支付的款项。

合同无效后的法律后果

1. 返还财产：合同被确认无效后，因该合同取得的财产，应当予以返还。如果公司已经按照合同约定向对方支付了款项，对方应当将款项返还给公司；如果对方已经向公司交付了货物或提供了服务，公司也应当将货物返还或按照市场价格支付相应的费用（但如果货物已经使用或无法返还，可能需要折价补偿）。
2. 赔偿损失：有过错的一方应当赔偿对方因此所受到的损失。在这个案例中，员工和供应商作为有过错的一方，应当赔偿公司因合同无效所遭受的损失，比如公司为了处理该合同纠纷而支付的律师费、诉讼费等费用，以及因合同无效而错过的其他商业机会所造成的损失等。
3. 追责员工：公司还可以根据内部的规章制度和相关法律法规，对涉事的员工进行追责。比如，公司可以解除与员工的劳动合同，并要求员工赔偿公司因员工的不当行为所遭受的损失。如果员工的行为涉嫌犯罪，公司还可以向公安机关报案，追究员工的刑事责任。

特殊情况说明

虽然一般情况下恶意串通损害公司利益的合同会被认定为无效，但也存在一些特殊情况。比如，如果公司事后对该合同进行了追认，即公司明确表示同意按照该合同的条款履行义务，那么该合同可能会被认定为有效。不过，公司追认合同需要满足一定的条件，比如公司必须是在知道员工与他人恶意串通的情况下仍然自愿追认，且追认行为不能损害国家、集体或第三人的利益等。

如果你遇到了企业员工与他人串通签订损害公司利益合同的情况，可以收集相关证据，如合同文本、员工与他人的沟通记录、资金往来凭证等，及时向我咨询具体的维权策略。