寺庙签订的三方协议是否有效，需根据具体情况判断，但一般来说，只要协议内容合法、主体适格、意思表示真实且不违反法律强制性规定，该协议就是有效的。以下从不同角度进行分析：

一、协议内容合法性

1. 协议内容不违反法律、行政法规的强制性规定：这是协议有效的基本前提。如果协议内容涉及违法活动，如赌博、贩毒等，那么该协议自始无效。
2. 协议内容不违背公序良俗：公序良俗是社会公共秩序和善良风俗的简称，如果协议内容违背了社会公共利益或道德准则，如约定进行不道德的交易，那么该协议也可能被认定为无效。

二、协议主体适格性

1. 寺庙作为协议一方需具备民事行为能力：寺庙作为法人或其他组织，需具备签订协议的民事行为能力。如果寺庙因某种原因被撤销或注销，那么其签订的协议可能因主体不适格而无效。
2. 其他两方也需具备相应的民事行为能力：除了寺庙外，协议的其他两方也需具备签订协议的民事行为能力，如自然人需具备完全民事行为能力，法人或其他组织需依法设立并具备相应的资质。

三、意思表示真实性

1. 协议各方需真实表达意愿：协议是各方意思表示一致的产物，如果协议是在欺诈、胁迫或乘人之危的情况下签订的，那么受损害方有权请求法院或仲裁机构变更或撤销该协议。
2. 协议内容需明确无误：协议内容应清晰明确，避免产生歧义或误解。如果协议内容存在模糊不清或相互矛盾的情况，那么可能影响协议的效力。

四、具体案例分析

• 案例一：如果寺庙与两家企业签订了一份关于寺庙维修工程的协议，协议内容明确、合法，且各方均具备相应的民事行为能力，意思表示真实，那么该协议就是有效的。
• 案例二：如果寺庙与个人签订了一份关于寺庙内部文物交易的协议，但该交易违反了文物保护法的相关规定，那么该协议就是无效的。

五、法律建议

1. 在签订协议前进行充分审查：寺庙在签订三方协议前，应对协议内容进行充分审查，确保协议内容合法、明确且不违背公序良俗。
2. 咨询专业律师：如果寺庙对协议的法律效力存在疑问或担忧，可以咨询专业律师进行法律评估和建议。
3. 保留相关证据：在签订和履行协议过程中，寺庙应保留好相关证据，如协议文本、往来函件、支付凭证等，以备不时之需。

总结来说，寺庙签订的三方协议是否有效需根据具体情况判断。如果协议内容合法、主体适格、意思表示真实且不违反法律强制性规定，那么该协议就是有效的。 如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。