结论：该处罚是否过重需结合具体情形判断，若面包车后排座椅未安装属于擅自改变机动车已登记结构且未备案，则交警处罚有法律依据；若存在特殊情节或程序瑕疵，可能存在减轻处罚空间。

1. 法律定性：擅自改变机动车结构属于违法行为

根据《中华人民共和国道路交通安全法》第十六条第一项规定，任何单位或个人不得擅自改变机动车已登记的结构、构造或特征。面包车后排座椅属于车辆原始结构的一部分，若车主自行拆除且未向车辆管理所申请变更登记，即构成违法行为。
交警依据《道路交通安全法》第九十条（对违反机动车登记规定的行为可处警告或20-200元罚款）或地方性法规（如《XX省道路交通安全条例》中可能提高罚款幅度至500元）进行处罚，在法律框架内具有合理性。

2. 处罚幅度是否过重的判断标准

• 地方性法规的补充规定：部分省份在《道路交通安全法》基础上，通过地方条例对特定违法行为提高罚款上限。例如，若某省条例明确规定“擅自改变机动车结构且未备案的，处500元罚款”，则交警处罚符合地方规定。
  
• 情节轻重的影响：若拆除座椅用于非法营运（如超员载客）、存在安全隐患（如未固定货物导致车辆重心偏移），或车主拒不整改，交警可能从重处罚；反之，若首次违法且能立即恢复原状，可能适用警告或最低罚款。
  
• 程序合法性：交警需依法出示执法证件、告知违法事实及依据、听取陈述申辩，并出具处罚决定书。若程序存在瑕疵（如未告知救济途径），可申请行政复议或提起行政诉讼。

3. 建议处理方式

• 核实处罚依据：要求交警出具处罚决定书，查看引用的具体法律条款及地方性法规，确认罚款500元是否合法。
  
• 申请复议或诉讼：若认为处罚过重或程序违法，可在收到决定书60日内向同级人民政府或上级交警部门申请行政复议，或直接向法院起诉。
  
• 主动整改：若座椅已被拆除，建议尽快恢复原状并到车管所备案，避免后续再次被罚。

提示：道路交通安全法规旨在保障公共安全，擅自改变车辆结构可能影响制动、转向等性能，增加事故风险。建议遵守登记规定，确需改装时依法办理变更手续。如有其他疑问，可进一步向我咨询具体法律条文或案例。