核心结论：针对未经上级领导批准擅自签订合同造成公司财务损失的情况，处理方式需结合公司内部管理规定、员工职责范围及具体损失情况综合判断，一般可从内部追责、民事赔偿、劳动纪律处分、刑事责任（如构成犯罪）四个角度处理。以下是具体分析：

1. 公司内部追责与制度适用

• 依据：若公司章程、员工手册或授权管理制度明确规定“合同签订需上级审批”，员工擅自签订的行为属于违反内部管理规定。
• 处理方式：
  • 追偿损失：公司可依据内部制度要求员工赔偿部分或全部损失（需证明损失与员工行为存在直接因果关系）；
  • 纪律处分：根据情节轻重给予警告、记过、降职、解雇等处分（需符合《劳动合同法》中“严重违反规章制度”的解雇条件）。
• 注意：若公司未明确规定审批流程，员工可能以“表见代理”抗辩（即相对方有理由相信其有代理权），此时公司需承担合同责任，但可向员工追偿因管理过失导致的损失。

2. 民事赔偿责任的认定

• 法律依据：根据《民法典》第1165条，员工因故意或重大过失造成公司损失的，应承担赔偿责任。
• 关键点：
  • 过错程度：需证明员工存在“故意”或“重大过失”（如明知无权仍签订、未尽基本审查义务等）；
  • 损失范围：仅赔偿实际直接损失（如合同违约金、差价损失等），不包括间接损失（如预期利润）；
  • 举证责任：公司需提供合同文本、审批记录、损失计算依据等证据。

3. 劳动纪律与合同解除

• 合法解除条件：若员工行为构成《劳动合同法》第39条“严重失职，营私舞弊，给用人单位造成重大损害”，公司可无偿解除劳动合同。
• 操作建议：
  • 制度依据：确保公司规章制度中明确“擅自签订合同导致损失”属于“严重违反规章制度”；
  • 程序合规：解除前需通知工会、听取员工申辩，并保留书面记录；
  • 损失证明：需提供财务审计报告等证据证明“重大损害”（通常需达到当地月工资标准的数倍）。

4. 刑事责任风险（极端情况）

• 可能罪名：若员工存在伪造公章、虚构事实骗取合同相对方财物等行为，可能涉嫌《刑法》第164条（对非国家工作人员行贿罪）、第224条（合同诈骗罪）或第271条（职务侵占罪）。
• 处理方式：公司可向公安机关报案，由司法机关追究刑事责任，同时可提起刑事附带民事诉讼要求赔偿。

实务建议

1. 立即固定证据：保存合同文本、审批记录、损失凭证、员工沟通记录等；
2. 内部调查：通过询问相关人员、调取监控等方式还原事实；
3. 协商处理：优先与员工协商赔偿方案，降低诉讼成本；
4. 法律程序：若协商无果，可依据《劳动争议调解仲裁法》申请仲裁，或直接向法院起诉要求赔偿。

提示：具体处理需结合合同内容、损失金额、员工主观状态等细节，建议提供更多信息以便进一步分析。