结论：单位出具的证明在套改工资审批表姓名有同音被划掉改成正确字的情况下，通常是有用的，但具体效力需结合实际情况判断。以下从不同角度进行分析：

1. 证明的效力基础：

   • 单位出具的证明属于书证的一种，其效力取决于证明内容的真实性、合法性以及与案件事实的关联性。在套改工资审批表姓名有误的情况下，单位出具的证明能够直接说明姓名更正的事实和原因，因此具有较高的证明力。

2. 证明的具体作用：

   • 确认身份：证明可以明确被划掉姓名与更正后姓名为同一人，避免因姓名同音或相似导致的身份混淆。
   • 纠正错误：证明可以说明套改工资审批表中的姓名错误是由于笔误、录入错误等原因造成的，并已经得到更正，从而确保工资审批的准确性和公正性。
   • 作为证据：在后续可能出现的劳动争议或法律纠纷中，单位出具的证明可以作为重要证据，支持员工的合法权益。

3. 证明的出具要求：

   • 内容真实：证明内容必须真实可靠，不得虚构或夸大事实。
   • 形式合法：证明应当以书面形式出具，并加盖单位公章或相关负责人签字，以确保其法律效力。
   • 及时出具：在发现姓名错误后，单位应及时出具证明，以便员工及时纠正错误并办理相关手续。

4. 可能遇到的挑战及应对：

   • 对方不认可：如果对方（如工资审批部门或劳动争议仲裁机构）对单位出具的证明不认可，员工可以进一步提供其他证据（如身份证、工作证、工资单等）来佐证姓名更正的事实。
   • 证明内容争议：如果对方对证明内容提出异议，员工可以要求单位对证明内容进行补充或说明，或者通过法律途径解决争议。

5. 法律建议：

   • 保留证据：员工在收到单位出具的证明后，应妥善保管，并留存复印件或电子版以备不时之需。
   • 及时沟通：如果员工在办理工资审批或相关手续时遇到姓名错误的问题，应及时与单位沟通并要求出具证明，以便及时纠正错误。
   • 寻求法律帮助：如果员工在处理姓名错误问题时遇到法律纠纷或无法解决的问题，可以向专业律师咨询并寻求法律帮助。

总结：单位出具的证明在套改工资审批表姓名有同音被划掉改成正确字的情况下通常是有用的，但具体效力需结合实际情况判断。员工应确保证明内容真实、形式合法，并及时与单位沟通以纠正错误。如有需要，可寻求专业律师的法律帮助。