公司辞退员工后又要扣工资，其合法性需根据具体情况来判断。以下是从不同角度进行的详细分析：
一、不合法的情况
无故扣发工资：
- 法律依据：根据《中华人民共和国劳动法》第五十条，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。同时，《工资支付暂行规定》第九条也明确规定，劳动关系双方依法解除或终止劳动合同时，用人单位应在解除或终止劳动合同时一次付清劳动者工资。
- 具体情形：若员工在工作期间表现良好，未违反公司规定，也未给公司造成任何经济损失，公司仅以辞退为由扣除员工工资，这种行为属于无故克扣工资，是违法的。例如，公司因自身经营策略调整而辞退员工，却无故扣除员工最后一个月的部分工资，这种做法是不合法的。
规章制度不合法或未公示：
- 法律依据：若公司依据未经民主程序制定或未向劳动者公示的规章制度扣发工资，该规章制度对员工不具有约束力，扣工资行为也是不合法的。
- 具体情形：公司未经讨论和公示就发布新规定，并以员工违反该规定为由扣工资，这种做法是不合法的。
二、合法的情况
因员工过错造成经济损失的扣除：
- 法律依据：根据《工资支付暂行规定》第十六条，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除，但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。
- 具体情形：若员工在工作过程中，由于故意或重大过失给公司造成了经济损失，公司有权要求员工赔偿，并在符合法律规定的扣除范围内从工资中扣除相应款项。例如，员工因违规操作导致公司设备损坏，经评估损失较大，公司在与员工协商一致后，在法律规定的扣除范围内从其工资中扣除赔偿费用，这种情况下扣工资是合法的。
依据合法有效的规章制度扣除：
- 法律依据：如果公司有经过民主程序制定且已向劳动者公示的合法规章制度，明确规定了在员工违反特定规定时，公司有权扣除相应工资，并且该规定不违反法律法规的强制性规定，那么在员工违反这些规定并被辞退时，公司按照规定扣工资是合法的。
- 具体情形：若规章制度中明确规定了员工故意损坏公司设备需承担赔偿责任，且员工确实存在此类行为，公司可以依据规定扣除相应工资作为赔偿。
三、员工权益保障与建议
- 协商解决：如果员工认为公司无故扣除了自己的工资，首先可以尝试与公司进行协商解决，要求公司支付被扣发的工资。
- 投诉举报：协商不成的情况下，员工可以向当地的劳动监察部门投诉，请求其介入调查并维护自己的合法权益。
- 申请劳动仲裁：员工还可以选择申请劳动仲裁，通过法律途径来解决纠纷。在申请劳动仲裁时，员工需要提供充分的证据来证明公司存在无故扣工资的行为。
- 提起诉讼：对仲裁结果不满意时，员工可向人民法院提起诉讼，通过法律途径维护自身权益。
总结：公司辞退员工时扣工资是否合法，需根据具体情况来判断。员工应了解自己的合法权益，并在遇到问题时采取适当的措施来维护自己的权益。如果你在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。