核心结论：可以通过签订一份《房产共有协议》或《赠与合同补充协议》，明确约定该农村房产虽已过户至哥哥名下，但弟弟仍享有50%的产权份额。以下为具体操作建议及合同要点：

一、合同类型选择及适用场景

1. 《房产共有协议》

   • 适用场景：若过户后房产仍为兄弟共同共有（如因继承、分家析产等非买卖原因过户），或双方希望明确共有关系。
     
   • 核心条款：
     
     • 明确房产地址、面积、产权证号等基本信息；
       
     • 约定“该房产由哥哥和弟弟按50%比例共同共有，哥哥仅作为名义产权人代持”；
       
     • 规定共有权行使方式（如出租、出售需双方同意）；
       
     • 约定未来产权变更（如拆迁、继承）时的分配规则。

2. 《赠与合同补充协议》

   • 适用场景：若过户行为本身为赠与性质（如父母将房产赠与哥哥，但约定弟弟有份额），需通过补充协议修正原赠与合同。
     
   • 核心条款：
     
     • 确认原赠与合同的有效性，并说明“原赠与目的为兄弟共同受益”；
       
     • 明确“哥哥受赠后，弟弟自动取得50%产权份额”；
       
     • 约定哥哥不得擅自处分房产（如抵押、出售），否则需赔偿弟弟损失。

二、合同关键条款设计（以共有协议为例）

**《房产共有协议》**  
甲方（哥哥）：姓名、身份证号、联系方式  
乙方（弟弟）：姓名、身份证号、联系方式  

**第一条 房产信息**  
1. 房产地址：××省××市××县××村××号  
2. 产权证号：××××××  
3. 现状：已过户至甲方名下，但实际为甲乙双方共同共有。  

**第二条 共有份额**  
1. 甲乙双方各享有50%产权份额；  
2. 甲方仅作为名义产权人，不得单独处分房产（包括但不限于出售、抵押、赠与）。  

**第三条 共有权行使**  
1. 房产出租、维修等日常管理事项，需双方协商一致；  
2. 如需出售房产，需双方共同签署买卖合同，所得款项按份额分配。  

**第四条 违约责任**  
若甲方擅自处分房产，需向乙方支付房产市场价值50%的违约金，并赔偿乙方全部损失。  

**第五条 其他**  
本协议自双方签字后生效，一式三份，甲乙双方各执一份，村委会备案一份。  

甲方（签字）：__________  
乙方（签字）：__________  
日期：__________  

三、操作注意事项

1. 农村房产特殊性：

   • 需确认房产是否为合法建筑（如有无宅基地证、建房许可证）；
     
   • 若涉及宅基地使用权，需符合“一户一宅”原则，且弟弟需为本村集体经济组织成员。
     

2. 公证或见证：

   • 建议对合同进行公证，或邀请村委会、亲属作为见证人签字，增强证据效力。
     

3. 产权登记变更：

   • 若条件允许，可向不动产登记中心申请“按份共有”登记，将弟弟的份额直接记载于产权证上（需当地政策支持）。
     

4. 家庭协商：

   • 签订前需与其他家庭成员（如父母、配偶）沟通，避免后续纠纷。
     

提示：合同条款需根据具体案情调整，建议签订前携带房产证、身份证等材料与我进一步沟通，确保协议合法有效。