关于您提出的“交通事故赔偿协议是否必须双方申请（这里理解为双方签字确认）”的问题，这主要取决于协议的处理方式和性质。以下是我为您详细梳理的情况：
一、一般情况
在大多数情况下，交通事故赔偿协议书是需要双方当事人签字确认的。这是因为：
合同原则：交通事故赔偿协议本质上属于合同范畴，是事故双方或多方当事人意思表示一致的产物。根据合同法的基本原则，当事人的签字行为意味着对协议内容的明确认可，并表明愿意受协议条款的约束。
法律效力：只有当事人亲自签字，才能确保协议真实反映其意愿，从而具备合同成立与生效的基本条件。若缺乏当事人的签字，将无法证明其对赔偿金额、方式、期限等关键条款达成了共识，协议的合法性和有效性将因此受到质疑。
二、特殊情况
尽管一般情况下需要双方签字，但也存在一些特殊情况：
无民事行为能力人或限制民事行为能力人：
- 如果交通事故当事人为无民事行为能力人（如不满八周岁的未成年人、不能辨认自己行为的成年人）或限制民事行为能力人（如八周岁以上不能完全辨认自己行为的未成年人），则其法定代理人（通常是父母或其他监护人）的签字将使赔偿协议书具有法律效力。
当事人授权他人代签：
- 当事人可以通过出具明确的授权委托书，委托他人代为签订交通事故赔偿协议书。被授权人在授权范围内以当事人的名义签字，其法律后果直接由当事人承担。但授权委托书应详细载明委托事项、权限及期限，并由当事人本人签名或盖章以确保其真实性。
交警调解下的特殊情况：
- 如果双方通过交警的调解达成了赔偿协议，但一方当事人拒绝签字或无法联系到一方当事人时，交警可能会根据事故现场的证据和法律规定，制作一份事故认定书或调解书，并送达给双方当事人。即使一方未签字，只要另一方能够证明其已按照协议内容履行了赔偿义务，且该协议不违反法律法规的强制性规定，那么这份协议仍然可能具有法律效力。
三、签字前的注意事项
- 在签字前，当事人务必仔细审阅协议内容，确保其真实、合法、有效，并完全符合自己的意愿和利益。
- 若对协议内容存在任何疑问或不满，应及时提出并与对方协商修改，以避免后续可能出现的纠纷。
四、法律程序与调解
- 如果事故双方未要求签订书面赔偿协议，交通警察可在道路交通事故认定书上载明相关情况，并将认定书交付当事人。
- 如果当事人对损害赔偿存在争议，且各方一致请求公安机关交通管理部门进行调解，则应在收到认定书或复核结论之日起十日内向相关部门提出书面申请。
综上所述，交通事故赔偿协议书的签字问题并非绝对，而是取决于多种因素。在实际操作中，建议您根据具体情况咨询专业律师或相关机构，以确保协议的签订过程符合法律法规的要求，并充分保障您的合法权益。