结论：挂名法人辞退申请书可以通过微信直接发送给实际控制人，但这种方式在法律效力和证据留存上可能存在一定风险，建议采取更为正式和稳妥的方式。

分析说明：

1. 法律效力角度：

   • 从法律形式上看，微信作为一种即时通讯工具，其发送的信息在符合一定条件下（如能够证明发送者和接收者的身份、信息内容未被篡改等）可以作为证据使用。然而，在劳动纠纷或辞退等正式法律程序中，书面文件（如纸质辞退通知书）通常具有更高的法律效力和认可度。
   • 如果实际控制人认可微信发送的辞退申请书，并据此采取了相应行动（如办理辞退手续），那么该申请书在实践中可能被视为有效。但若实际控制人否认或提出异议，微信发送的申请书可能因缺乏正式形式而面临举证困难。

2. 证据留存角度：

   • 微信聊天记录容易丢失或被删除，且难以保证信息的完整性和未被篡改。在劳动纠纷中，证据的完整性和真实性至关重要，因此，通过微信发送辞退申请书可能不利于证据的留存和展示。
   • 相比之下，书面文件可以更容易地保存、复制和展示，且在法律程序中具有更高的可信度。

3. 实际操作建议：

   • 正式书面通知：建议挂名法人以书面形式（如纸质辞退通知书）向实际控制人提出辞退申请，并确保通知书上载明辞退的原因、时间、补偿等关键信息。
   • 送达方式：书面通知书可以通过邮寄、当面送达等方式送达实际控制人，并保留好送达凭证（如邮寄回执、签收单等）。
   • 微信辅助沟通：在发送书面通知书的同时，可以通过微信等即时通讯工具与实际控制人进行沟通，确认其已收到通知书并了解相关内容。但微信沟通内容应作为辅助证据，而非主要证据。

特殊场景：

• 如果实际控制人明确表示同意通过微信接收辞退申请书，并承诺会据此办理相关手续，那么在这种情况下，通过微信发送申请书可能是可行的。但即便如此，也建议挂名法人后续补发书面通知书，以完善法律手续。

后续行动建议：

• 在提出辞退申请后，挂名法人应密切关注实际控制人的反应和后续行动，确保自己的权益得到保障。
• 如果实际控制人拒绝辞退或提出异议，挂名法人应及时咨询专业律师，了解自己的法律权益和应对策略。

风险提示：

• 通过微信发送辞退申请书可能存在法律效力和证据留存上的风险，建议谨慎使用。
• 在处理劳动纠纷时，应遵循相关法律法规和程序要求，确保自己的行为合法合规。

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