结论：公司把考勤权限设置成别的部门的，员工是否还可以继续打卡，这主要取决于公司的具体考勤制度以及该权限设置是否实质上阻碍了员工正常打卡。以下从不同角度进行分析：

1. 公司考勤制度的角度：

   • 如果公司的考勤制度明确规定了打卡的方式、地点或权限，并且该制度已经通过合理的方式（如员工手册、内部通知等）告知了员工，那么员工应当遵守该制度。若权限设置并未改变打卡的实质方式（如仍可通过原有设备或系统打卡），只是管理权限的转移，则员工应继续按照原方式打卡。
   • 若公司考勤制度未明确规定打卡权限必须由本部门管理，或者该权限设置并未对员工打卡造成实质性障碍（如员工仍能正常访问打卡系统或设备），则员工应继续打卡，不受权限设置影响。

2. 权限设置是否阻碍打卡的角度：

   • 如果公司将考勤权限设置成别的部门后，导致员工无法正常访问打卡系统或设备，或者打卡流程变得复杂且不合理，从而实质上阻碍了员工打卡，那么员工有权向公司提出异议，并要求公司恢复正常的打卡条件。
   • 在此情况下，员工应保留相关证据（如无法打卡的截图、与公司的沟通记录等），以备后续维权之需。

3. 法律后果与建议：

   • 从法律角度来看，公司有权根据自身管理需要设置考勤权限，但不得违反法律法规或劳动合同的约定，也不得损害员工的合法权益。如果公司的权限设置违反了相关法律法规或劳动合同，员工有权向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁。
   • 建议：员工在遇到此类情况时，首先应与公司进行沟通，了解权限设置的具体原因和目的，并尝试协商解决。如果沟通无果，且认为公司的行为损害了自己的合法权益，可以寻求法律援助或向相关部门投诉。

进一步思考：在实际操作中，公司考勤权限的设置往往与公司的管理策略、组织架构调整等因素有关。员工在面对此类变化时，应保持冷静，理性分析，并通过合法途径维护自己的权益。同时，公司也应注重员工的感受和需求，确保考勤制度的合理性和公平性，以维护良好的劳动关系。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。