结论：学生考上学后，三方协议是否算违约，需根据协议具体内容、签订目的及实际情况综合判断。以下从不同角度进行分析：
1. 三方协议的法律性质与目的
三方协议通常指学校、学生、用人单位三方签订的就业意向协议，旨在明确毕业生毕业后到用人单位工作的意向，并约定相关权利义务。其性质属于预约合同（即约定未来签订正式劳动合同的协议），而非正式劳动合同本身。
若协议中明确约定“考上研究生/公务员等情形可解除协议”：
此类条款属于双方约定的解除条件。学生考上学后，可依据协议约定主张解除，不构成违约。例如，协议中写明“若学生被录取为全日制研究生，本协议自动终止”，则学生无需承担违约责任。
若协议未约定解除条件：
需进一步分析学生考上学是否属于“不可抗力”或“情势变更”情形。根据《民法典》第533条，若考上学导致原协议目的无法实现（如学生无法按约到用人单位工作），且双方未协商一致，可主张变更或解除协议。但实践中，考上学通常不被直接认定为“不可抗力”，因此需与用人单位协商解除。
2. 学生考上学是否构成违约的关键因素
协议是否包含“升学免责”条款：
若协议明确排除升学作为违约情形（如“学生因升学、参军等原因无法履约的，不承担违约责任”），则学生无需赔偿。
学生是否履行通知义务：
即使协议未约定解除条件，学生也应及时通知用人单位并说明情况，避免用人单位因信息不对称产生损失。若学生未通知且用人单位已为入职做准备（如拒绝其他候选人），可能需承担部分赔偿责任。
用人单位是否遭受实际损失：
违约责任以填补损失为原则。若用人单位未因学生考上学产生实际损失（如未支付培训费、未产生招聘成本），学生可能无需赔偿；反之，可能需赔偿合理损失（如已支付的签约奖金、差旅费等）。
3. 实践中的常见处理方式
协商解除：
多数情况下，用人单位会理解学生升学需求，双方协商一致后解除协议，无需承担违约责任。
支付违约金：
若协议约定违约金条款（如“未履约需支付5000元违约金”），学生需注意：
4. 建议与风险提示
审查协议条款：
学生应仔细阅读协议中关于解除、违约责任、赔偿范围的约定，明确自身权利义务。
及时沟通协商：
考上学后，第一时间与用人单位和学校沟通，说明情况并协商解决方案，避免纠纷升级。
保留证据：
保存录取通知书、协议文本、沟通记录等证据，以备争议时使用。
总结：学生考上学后，三方协议是否违约需结合协议条款和实际情况判断。若协议允许升学解除或双方协商一致，通常不违约；若协议无约定且协商未果，可能需承担部分赔偿责任。建议学生优先通过协商解决问题，必要时咨询专业律师协助处理。如有进一步疑问，可直接向我咨询。