针对您提出的“公司行政处罚怎么处理”的问题，这确实是一个涉及企业运营管理和法律合规的重要方面。下面我将结合相关法规和原则，为您详细解答。
首先，当公司面临行政处罚时，最重要的是要明确处罚的依据和性质。行政处罚通常基于公司违反了某项行政法规或规章，市场监督管理部门等行政机关会依据相关法律法规对公司进行处罚。处罚的种类和幅度会与公司的违法行为的事实、性质、情节以及社会危害程度相当，这遵循的是“过罚相当”原则。
一、关于违法所得的认定与处理
根据《市场监督管理行政处罚案件违法所得认定办法》，违法所得是指实施违法行为所取得的款项，且应当与当事人所实施的违法行为直接相关。在处理违法所得时，市场监督管理部门会考虑扣除当事人直接用于生产经营活动的合法必要支出。这意味着，如果公司能够提供真实、完整的证据材料证明某些支出是合法且必要的，那么这些支出在计算违法所得时是可以被扣除的。
二、行政处罚的处理流程
接受调查与听证：当公司被怀疑存在违法行为时，市场监督管理部门会展开调查。公司有权配合调查，并在必要时申请听证，以阐述自己的立场和提供相关证据。
接收处罚决定书：调查结束后，如果市场监督管理部门认定公司存在违法行为，会向公司发出行政处罚决定书，明确处罚的种类、幅度和依据。
履行处罚决定：公司需要按照处罚决定书的要求履行处罚，如缴纳罚款、没收违法所得等。如果公司对处罚决定有异议，可以在法定期限内申请行政复议或提起行政诉讼。
整改与预防：除了履行处罚决定外，公司还需要对违法行为进行整改，并采取措施预防类似违法行为的再次发生。这有助于提升公司的合规管理水平，降低未来面临行政处罚的风险。
三、如何做到过罚相当
“过罚相当”原则要求行政机关在作出行政处罚决定时，必须准确判断违法行为的性质和大小，并作出种类和幅度与违法行为相当的处罚。为了实现这一原则，公司可以：
积极配合调查：在调查过程中，公司应如实提供相关信息和证据，帮助行政机关准确判断违法行为的性质和大小。
主动消除危害后果：如果公司能够主动采取措施消除或减轻违法行为的危害后果，如召回问题产品、赔偿消费者损失等，这有助于降低处罚的幅度。
寻求专业法律帮助：在处理行政处罚时，公司可以寻求专业律师的帮助，以确保自己的权益得到充分保障，并遵循法律程序进行申诉或辩护。
四、建议与总结
面对行政处罚，公司应保持冷静和理性，积极配合行政机关的调查和处理工作。同时，公司也应加强自身的合规管理，建立健全的内部控制制度，预防类似违法行为的再次发生。如果公司对处罚决定有异议或认为处罚过重，可以通过合法途径进行申诉或辩护。
总之，处理公司行政处罚需要遵循法律法规和“过罚相当”原则，确保处罚的公正性和合理性。希望以上解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的法律帮助，请随时咨询。