结论：在总价包干合同中约定变更按定额套取且合同内有定额，意味着合同履行过程中发生变更事项时，变更部分的价款计算依据是合同内约定的定额标准。以下从不同方面详细解释：

1. 总价包干合同的基本概念 总价包干合同，是指发包人和承包人约定以施工图及其预算和有关条件进行合同价款计算、调整和确认的建设工程施工合同，在约定的范围内合同总价一次包死，固定不变。也就是说，除合同另有约定外，无论实际施工情况如何，承包人都应按照合同约定的总价完成工程，承担工程量变化、物价波动等风险。

2. 变更按定额套取的含义 尽管总价包干合同在约定范围内总价固定，但在实际施工过程中，由于各种原因（如设计变更、发包人要求的变化等）可能会导致工程内容发生变更。当出现这种情况时，就需要对变更部分的价款进行计算和调整。此时约定按定额套取，就是以合同内约定的定额作为计算变更部分价款的依据。定额是规定消耗在单位工程基本结构要素上的劳动力、材料和机械数量标准，是计算建筑安装产品价格的基础。

3. 合同内有定额的作用

   • 明确计价标准：合同内约定的定额为变更部分的价款计算提供了明确、统一的标准，避免了双方在变更价款计算上产生争议。例如，如果合同约定按照某地区最新的建筑工程预算定额来计算变更价款，那么在发生变更时，双方就可以依据该定额中相应的子目和计算规则来确定变更部分的工程量和单价，进而计算出变更价款。
   • 保障公平合理：定额是经过专业机构编制和审核的，具有一定的科学性和合理性。以定额为依据计算变更价款，能够在一定程度上保障双方的利益，使变更价款的计算更加公平合理。它既考虑了施工企业的实际成本投入，也兼顾了发包人的利益，避免了因价款计算不合理而导致的纠纷。

4. 实际操作中的注意事项

   • 定额的适用范围：要明确合同内约定的定额适用于哪些变更情况。有些变更可能是由于发包人的原因导致的，有些可能是由于不可抗力等不可预见、不可避免的因素导致的，不同的变更原因可能会影响定额的适用。例如，如果是发包人提出的设计变更，导致工程量增加，那么按照合同约定应按定额套取计算增加部分的价款；但如果是由于不可抗力导致的工程损坏需要修复，可能需要根据实际情况和相关法律法规的规定来确定是否适用定额以及如何适用。
   • 定额的更新和调整：定额可能会随着时间、市场情况等因素的变化而进行更新和调整。在合同履行过程中，如果出现了新的定额版本，需要明确是继续按照合同内约定的旧定额执行，还是采用新的定额。一般来说，如果合同没有特别约定，应按照合同内约定的定额执行；但如果新定额更能反映实际情况，且双方协商一致，也可以采用新定额。
   • 变更的确认和审批：在发生变更时，要及时按照合同约定的程序进行变更的确认和审批。只有经过发包人确认的变更，才能按照定额套取计算价款。同时，要注意保存好相关的变更资料，如变更通知、设计变更图纸、现场签证等，以便在计算变更价款时有充分的依据。

如果在总价包干合同履行过程中遇到关于变更按定额套取的具体问题，欢迎随时向我咨询。