行政拘留后被纪委立案，工资待遇的处理需分情况讨论，具体如下：

1. 行政拘留本身对工资待遇的影响
   行政拘留属于行政处罚，根据《公务员法》及《事业单位工作人员处分暂行规定》，单纯行政拘留（未被纪委立案或未构成犯罪）通常不会直接导致工资停发，但可能影响年度考核结果（如不称职或不确定等次），进而间接影响绩效工资或奖金发放。若单位内部规章制度明确规定行政拘留期间停发工资，则需按制度执行，但该制度需经民主程序制定并公示，否则可能因违法而无效。

2. 纪委立案后的工资待遇处理
   纪委立案通常意味着涉嫌违纪违法，此时工资待遇的处理需结合案件性质及处分结果：

   • 双规或留置期间：根据《监察法》及相关规定，被留置人员工资暂停发放，留置期满后若未被处分，可补发；若被处分（如警告、记过等），则按处分类型扣减相应比例的绩效工资或津贴。
     
   • 党纪处分影响：若纪委最终给予警告、严重警告等党纪处分，根据《中国共产党纪律处分条例》，可能影响职务晋升、职级调整，但工资一般不受直接影响；若给予撤职、开除党籍等重处分，则可能伴随降级、撤职等政务处分，导致工资按新职级重新核定。
     
   • 政务处分影响：若纪委立案后移送监察机关并给予政务处分（如警告、记过、降级、撤职、开除），根据《公职人员政务处分法》，工资待遇将按处分类型调整：
     
     • 警告：6个月内扣发绩效工资；
       
     • 记过：12个月内扣发绩效工资；
       
     • 降级、撤职：降低职务、职级或级别，工资按新标准发放；
       
     • 开除：自处分决定生效之日起，终止与单位的人事关系，工资停发。

3. 特殊情形：刑事立案后的工资处理
   若纪委立案后发现涉嫌犯罪并移送司法机关，根据《关于事业单位工作人员和机关工人被采取刑事强制措施和受刑事处罚工资待遇处理有关问题的通知》，工资待遇按以下方式处理：

   • 被取保候审、监视居住期间：原工资停发，按基本工资的75%计发生活费；
     
   • 被刑事拘留、逮捕期间：停发工资；
     
   • 一审判决有罪但免予刑事处罚、被判处管制、拘役或有期徒刑宣告缓刑：职务工资降一至两档，津贴按新职级标准发放；
     
   • 被判处有期徒刑以上刑罚：开除公职，工资终止。

建议：

• 及时向单位人事部门了解内部规章制度，确认工资停发或扣减的合法性；
  
• 若认为处分或工资处理违法，可申请复核或申诉；
  
• 涉及刑事犯罪的，需委托律师介入，争取从轻处理以减少对工资待遇的影响。
  

如有进一步疑问，可直接向我咨询具体案件细节及应对策略。