土地租赁合同纠纷中，《民法典》与《土地管理法》的适用需分情况讨论，二者并非非此即彼的关系，而是存在交叉适用空间。具体分析如下：

1. 基础法律关系优先适用《民法典》
   土地租赁合同本质属于民事合同，其成立、效力、履行、变更、终止等基础法律问题（如合同主体资格、意思表示真实性、租金支付方式、违约责任等）应优先适用《民法典》合同编相关规定。例如：

   • 若承租人未按约定支付租金，出租人可依据《民法典》第722条主张解除合同；
     
   • 若合同存在欺诈、胁迫等情形，当事人可依据《民法典》第148-151条主张撤销合同。

2. 土地用途管制等特殊问题适用《土地管理法》
   若租赁合同涉及土地用途变更、非法转租、突破规划限制等违反《土地管理法》强制性规定的情形，则需以该法为依据判定合同效力或处理行政责任。例如：

   • 承租人将农业用地转为建设用地未办理审批手续（《土地管理法》第44条），合同可能因违反法律强制性规定被认定无效；
     
   • 未经批准非法转让集体土地使用权（《土地管理法》第82条），除合同无效外，还可能面临行政处罚。

3. 特别法优先原则的例外情形
   当《土地管理法》对某类问题无具体规定时（如土地租赁合同纠纷中的损害赔偿范围），仍需回归《民法典》填补规则空白。例如：

   • 承租人因出租人隐瞒土地权属瑕疵遭受损失，若《土地管理法》未规定赔偿标准，可依据《民法典》第577条主张实际损失赔偿。

实务建议：处理土地租赁合同纠纷时，应同步审查合同条款与土地权属、规划文件，区分民事争议与行政违法问题。若涉及集体建设用地租赁、农用地转用等敏感领域，建议提前咨询律师评估法律风险。