在交通事故中双方负同等责任且车辆全损的情况下，保险公司支付车辆保险的方式主要取决于保险类型和定损金额，具体如下：
交强险部分
交强险的财产损失赔偿限额为2000元，无论责任比例如何，均由己方保险公司先行赔付对方车辆损失。若己方车辆全损，对方也需在交强险范围内赔偿己方2000元（若对方有责）。
商业险部分（车损险）
- 若投保车损险：保险公司按事故责任比例赔付。同等责任下，通常各承担50%损失。
- 计算方式：
（车辆实际价值 - 残值）× 50%（责任比例）
例如：车辆实际价值10万元，残值1万元，则赔付金额为（10万-1万）×50%=4.5万元。
- 注意：若车辆实际价值低于保额（即不足额投保），按实际价值比例赔付；若高于保额（即超额投保），最高不超过保额。
- 若未投保车损险：保险公司不赔付己方车辆损失，需自行承担或向对方追偿（但对方仅承担50%责任）。
对方商业险（第三者责任险）
己方车辆损失中，对方需承担的50%部分，由对方保险公司通过第三者责任险赔付。若对方未投保或保额不足，需由对方个人承担。
操作流程建议：
- 立即报案并保护现场，联系交警出具《事故责任认定书》；
- 联系己方保险公司定损，确定车辆实际价值及残值；
- 收集对方保险信息，协商赔付方案（或通过交警/法院调解）；
- 签署《全损协议》后，车辆残值归保险公司处理，赔款支付至被保险人账户。
特殊情形提醒：
- 若车辆实际价值争议较大，可委托第三方评估机构鉴定；
- 若对方拒不赔付，可凭《事故责任认定书》和保险合同向法院起诉；
- 及时关注保险条款中的“免赔率”或“绝对免赔额”约定（如有）。
如有进一步细节需要分析（如保险条款具体内容、车辆使用性质等），可直接向我咨询。