结论：在货物买卖合同中，合同上未明确规定的乱扣费一般是不合法的。不过，具体是否合法还需根据合同条款、交易习惯以及相关法律法规来综合判断。
分析角度一：合同条款的明确性
合同约定优先：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，合同是双方意思表示一致的产物，具有法律约束力。合同中明确约定的条款，双方应当严格遵守。如果合同中并未规定某些费用可以扣除，那么卖方或买方单方面扣除这些费用，就可能构成违约。
合同解释原则：如果合同条款存在模糊或不明确之处，应当按照通常理解或者有利于实现合同目的的方式解释。但无论如何解释，都不能违背合同的基本原则和公平交易的原则。
分析角度二：交易习惯与行业惯例
交易习惯的影响：在某些行业中，可能存在一些普遍接受的交易习惯或行业惯例。如果这些习惯或惯例与合同条款不冲突，且双方当事人在订立合同时均知晓并同意遵循，那么这些习惯或惯例也可以作为判断合同履行情况的依据。然而，这并不意味着卖方或买方可以随意根据交易习惯或行业惯例来扣除费用。
行业惯例的合理性：即使存在行业惯例，也需要判断其是否合理、合法。如果行业惯例本身就存在不公平、不合理的条款，那么这些条款是不能被采纳的。
分析角度三：相关法律法规的规定
消费者权益保护：如果买方是消费者，那么卖方的行为还可能受到《中华人民共和国消费者权益保护法》的保护。该法规定，经营者不得设定不公平、不合理的交易条件，不得强制交易。如果卖方乱扣费，就可能侵犯了消费者的合法权益。
合同法的其他规定：除了上述规定外，《中华人民共和国民法典》中还有关于合同履行、违约责任等方面的规定。如果卖方乱扣费构成违约，买方可以要求卖方承担违约责任，包括赔偿损失等。
建议与行动：
审查合同条款：首先，建议你仔细审查货物买卖合同的条款，特别是关于费用扣除的部分。如果合同中没有明确规定某些费用可以扣除，那么卖方或买方单方面扣除这些费用就是不合法的。
与对方协商：如果发现卖方或买方存在乱扣费的情况，你可以先与对方进行协商，要求对方说明扣费的理由和依据。如果对方无法提供合理的解释和依据，你可以拒绝支付这些费用。
寻求法律帮助：如果协商无果，你可以考虑寻求法律帮助。你可以咨询我，我会根据你的具体情况和合同条款，为你提供专业的法律意见和帮助。
保留证据：在处理此类纠纷时，保留好相关证据是非常重要的。你可以保存好合同、交易记录、扣费通知等证据材料，以便在需要时提供证明。
总之，货物买卖合同中合同上未明确规定的乱扣费一般是不合法的。如果你遇到了此类问题，不要慌张，先仔细审查合同条款，与对方协商解决；如果协商无果，可以寻求法律帮助来维护自己的合法权益。