矿山关停时，政府补偿与已缴纳的保证金能否退还，需分情况讨论，核心取决于保证金性质、关停原因及合同约定。以下从不同角度展开分析：

1. 若保证金为“复垦保证金”或“生态修复保证金”

根据《矿产资源法》及地方性法规，矿山企业需缴纳复垦保证金，用于确保关停后履行土地复垦、生态修复义务。

• 若企业已按要求完成修复并通过验收：政府应退还保证金本金及可能产生的利息（具体依合同约定）。
  
• 若企业未履行修复义务：政府有权扣除保证金用于自行修复，剩余部分（如有）退还；若保证金不足覆盖修复成本，企业还需补足差额。
  

关键点：需保留修复验收文件、保证金缴纳凭证等证据，以主张退还。

2. 若保证金为“安全生产保证金”或“履约保证金”

此类保证金通常用于约束企业规范开采、保障安全。

• 若关停非因企业违约（如政策性关停、资源枯竭）：且企业无未结安全生产罚款或违约行为，政府应全额退还保证金。
  
• 若关停因企业违法（如超层越界开采、未达安全标准）：政府可依法没收保证金，或抵扣罚款后退还余额。
  

关键点：需区分关停原因（政策性vs.违约性），并核查保证金合同中的没收条款。

3. 若保证金与政府补偿是独立法律关系

矿山关停时，企业可能同时涉及两类权益：

• 政府补偿：针对关停导致的直接损失（如设备搬迁费、员工安置费），与保证金无关。
  
• 保证金退还：需单独依据保证金合同主张，二者不冲突。
  

示例：企业因环保不达标被关停，政府支付补偿（用于员工安置），但因企业违约，保证金被没收。此时补偿与保证金退还分属不同法律关系，互不影响。

4. 实务建议

1. 核查合同条款：明确保证金性质、退还条件及没收情形。
   
2. 保留证据：包括缴纳凭证、关停通知、修复验收文件等。
   
3. 协商或诉讼：若政府无故拒退，可先协商；协商不成，可提起行政诉讼或民事诉讼（依保证金性质而定）。
   

总结：保证金能否退还需结合性质、关停原因及合同约定综合判断。若您有具体合同或关停文件，可进一步向我提供细节，我会为您分析退还可能性及操作路径。