在权利人与被投诉人协商解决商标侵权案的情况下，通常不会直接进行立案处罚，但具体是否处罚还需根据协商结果及后续行为来判断。以下从不同角度为你详细分析：

一、协商解决本身不直接导致立案处罚

1. 协商解决的性质：协商解决是权利人与被投诉人之间就商标侵权事宜进行的一种私下和解方式。在协商过程中，双方可以就赔偿金额、停止侵权行为等事项达成一致，并签订和解协议。这种解决方式本身并不涉及行政或司法程序的介入，因此不会直接导致立案处罚。

2. 行政处罚的启动条件：根据《中华人民共和国商标法》及相关规定，行政处罚通常是在商标管理部门发现商标侵权行为后，依法进行调查取证，并确认侵权行为成立的情况下才会启动。协商解决并不构成商标管理部门启动行政处罚的直接依据。

二、协商解决后可能面临的立案处罚情况

1. 协商未达成一致或未履行协议：如果权利人与被投诉人在协商过程中未能达成一致意见，或者虽然达成了协议但被投诉人未按照协议履行义务（如继续实施侵权行为、未支付赔偿金等），那么权利人可以向商标管理部门投诉或向人民法院提起诉讼。在这种情况下，商标管理部门或人民法院在确认侵权行为成立后，可能会对被投诉人进行立案处罚。

2. 协商解决过程中存在违法行为：如果在协商解决过程中，被投诉人存在隐瞒真相、提供虚假信息等违法行为，或者双方达成的和解协议违反法律法规的强制性规定，那么商标管理部门在发现这些情况后，也可能会对被投诉人进行立案处罚。

三、法律建议

1. 保留证据：在协商解决过程中，权利人应保留好与侵权行为相关的证据，如侵权商品、销售记录、广告宣传资料等。这些证据在后续可能涉及的行政或司法程序中具有重要作用。

2. 签订书面协议：为了确保协商解决的结果具有法律效力，双方应签订书面和解协议，并明确约定赔偿金额、停止侵权行为等具体事项。协议中还可以约定违约责任和争议解决方式等条款，以增加协议的约束力和可执行性。

3. 及时履行协议：双方应按照协议约定及时履行各自的义务。如果一方未履行协议义务，另一方可以依法追究其违约责任或向相关部门投诉。

4. 关注后续行为：即使协商解决成功，权利人也应持续关注被投诉人的后续行为。如果发现被投诉人继续实施侵权行为或存在其他违法行为，应及时向商标管理部门投诉或向人民法院提起诉讼。

总之，协商解决商标侵权案本身并不直接导致立案处罚，但具体是否处罚还需根据协商结果及后续行为来判断。如果你在商标侵权方面遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。