确认亲子关系可以缺席判决。在亲子关系确认案件中，如果被告经法院依法传唤拒不到庭，且原告已经向法院提供了必要证据予以证明亲子关系，法院在综合全案证据后，可以缺席判决确认亲子关系存在。

具体来说，根据相关法律规定，如《最高人民法院关于适用<中华人民共和国民法典>婚姻家庭编的解释(一)》第三十九条第二款，父或者母以及成年子女起诉请求确认亲子关系，并提供必要证据予以证明，另一方没有相反证据又拒绝做亲子鉴定的，人民法院可以认定确认亲子关系一方的主张成立。这一规定体现了亲子关系确认案件的特殊性，即该类案件在较大程度上依赖于亲子鉴定，因此要求被申请人应给予一定的配合。如果被申请人拒绝配合，如拒不到庭或拒绝做鉴定，那么主张亲子关系成立的一方可能会陷入无法举证的困境。但在此情况下，法院仍会根据原告提供的证据，以及法院自身的调查取证，对全案证据进行综合认定，并据此作出判决。

例如，在一个实际案例中，原告丁某向法院起诉请求确认其与被告康某之间存在亲子关系，并提供了DNA鉴定意见书、情况说明、微信聊天记录等必要证据。虽然被告康某经法院依法传唤拒不到庭，但法院在综合全案证据后，仍然判决确认丁小某与被告康某之间存在亲子关系。

因此，在确认亲子关系的诉讼中，即使被告缺席，法院也可以根据原告提供的证据和法院自身的调查取证，对亲子关系进行确认并作出判决。