结论：在《保障中小企业款项支付条例》生效前签订的合同，若条例生效后工程完工且存在欠款情况，利息是否适用该条例，需分情况讨论。一般来说，若合同未约定逾期付款利息计算方式，且符合条例适用范围，则可能适用条例规定的利息计算标准；若合同已明确约定，则通常按合同约定执行。

详细分析：

1. 条例的适用范围与时间效力：

   • 《保障中小企业款项支付条例》旨在保障中小企业款项得到及时支付，对于缓解中小企业资金压力、优化营商环境具有重要意义。该条例通常适用于条例生效后签订的合同，以及条例生效前签订但条例生效后履行（如工程完工、款项支付等）的合同部分。

2. 利息计算方式的约定：

   • 合同有约定：如果合同中已经明确约定了逾期付款的利息计算方式，那么根据合同自治原则，双方应按照合同约定执行。此时，即使条例生效，也不影响合同中已有约定的效力。
   • 合同无约定：如果合同中没有约定逾期付款的利息计算方式，或者约定不明确，那么可以参照条例的相关规定。条例中可能规定了逾期付款利息的计算标准，如按照中国人民银行同期同类贷款利率上浮一定比例计算等。在这种情况下，如果工程完工且存在欠款情况发生在条例生效后，那么利息的计算可能适用条例的规定。

3. 条例的具体规定与适用：

   • 条例中可能明确规定了逾期付款利息的计算方法、利率标准以及支付期限等。在适用条例时，需要仔细审查条例的具体条款，以确定是否满足适用条件。
   • 同时，还需要注意条例中可能存在的例外情况或特殊规定，如对于某些特定类型的合同或交易，条例可能不适用或适用特殊规则。

4. 实际操作建议：

   • 对于中小企业而言，在签订合同时应尽可能明确约定逾期付款的利息计算方式，以保障自身权益。
   • 如果合同未约定或约定不明确，且工程完工欠款发生在条例生效后，建议及时咨询专业律师，了解条例的具体规定和适用条件，以便在追讨欠款时主张合理的利息。

法律后果与风险提示：

• 如果未按照条例规定或合同约定主张逾期付款利息，可能导致中小企业在追讨欠款时面临利息损失。
• 同时，如果合同中的利息计算方式违反法律法规的强制性规定（如过高或过低的利率），也可能面临被法院调整的风险。

进一步行动建议：

• 建议您仔细审查合同条款，特别是关于逾期付款利息的计算方式。
• 如果合同未约定或约定不明确，且符合条例适用范围，您可以考虑依据条例规定主张逾期付款利息。
• 在实际操作过程中，如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。