结论：公司转代理时员工是否一起转以及是否有经济赔偿，这主要取决于员工与公司之间的劳动合同约定、公司转代理的具体情况以及相关法律法规的规定。以下从不同角度进行分析：
一、劳动合同约定
劳动合同中有明确约定：
- 如果劳动合同中明确规定了在公司转代理或类似情况下，员工需要随公司一起转移，并且转移后的工作条件、薪酬待遇等保持不变或有所改善，那么员工通常需要遵循合同约定，此时一般不涉及经济赔偿问题。
- 如果劳动合同中明确规定了在公司转代理时，员工有权选择是否继续留在公司，或者公司需要给予员工一定的经济补偿，那么员工可以根据合同约定来行使自己的权利。
劳动合同中没有明确约定：
- 如果劳动合同中没有对公司转代理时员工是否一起转以及经济赔偿等问题作出明确约定，那么就需要根据相关法律法规和实际情况来判断。
二、公司转代理的具体情况
公司整体转让或合并：
- 如果公司转代理实际上构成了公司整体转让或合并的一部分，那么根据《劳动合同法》的相关规定，原劳动合同继续有效，劳动合同由承继其权利和义务的用人单位继续履行。在这种情况下，员工通常不需要担心经济赔偿问题，因为新用人单位会继承原用人单位的权利和义务。
公司部分业务或资产转让：
- 如果公司只是转让了部分业务或资产，而员工的工作岗位和职责没有发生变化，那么员工通常需要继续履行原劳动合同，也不涉及经济赔偿问题。
- 如果公司转让部分业务或资产导致员工的工作岗位或职责发生变化，且这种变化对员工不利（如降薪、降职等），那么员工有权要求公司给予相应的经济补偿或拒绝变更劳动合同。
三、相关法律法规的规定
《劳动合同法》的相关规定：
- 根据《劳动合同法》第三十四条：“用人单位发生合并或者分立等情况，原劳动合同继续有效，劳动合同由承继其权利和义务的用人单位继续履行。”这意味着，在公司转代理构成合并或分立的情况下，员工通常不需要担心经济赔偿问题。
- 如果公司转代理导致劳动合同无法继续履行（如公司注销、破产等），那么根据《劳动合同法》的相关规定，公司需要给予员工相应的经济补偿。
其他相关法律法规：
- 除了《劳动合同法》外，还有一些地方性法规或规章可能对公司转代理时员工的权益保护作出具体规定。因此，在处理具体案件时，还需要考虑这些地方性法规或规章的适用。
四、实际操作建议
审查劳动合同：
- 员工应首先审查自己的劳动合同，了解其中对公司转代理时员工权益保护的具体约定。
与公司协商：
- 如果劳动合同中没有明确约定或约定不明确，员工可以与公司进行协商，就公司转代理时自己的权益保护问题达成一致意见。
寻求法律援助：
- 如果员工与公司无法就公司转代理时的权益保护问题达成一致意见，或者公司违反了相关法律法规的规定，员工可以寻求法律援助或向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。
总结：公司转代理时员工是否一起转以及是否有经济赔偿，这取决于多种因素的综合考虑。员工应首先审查自己的劳动合同，了解其中对公司转代理时员工权益保护的具体约定；如果劳动合同中没有明确约定或约定不明确，员工可以与公司进行协商或寻求法律援助。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。