结论：银行对执行和解协议提起民事诉讼时，立案的案由并不一定是金融借款合同纠纷，具体取决于执行和解协议的内容以及双方争议的焦点。
分析说明：
执行和解协议的性质：
- 执行和解协议是在执行过程中，双方当事人就执行标的、执行方式等事项达成的和解协议。它本身并不直接等同于原始的金融借款合同，而是对原始合同执行过程中的一种变更或补充。
案由的确定原则：
- 案由的确定通常基于当事人之间的法律关系以及争议的焦点。在民事诉讼中，案由应当准确反映当事人之间争议的法律关系的性质。
可能涉及的案由：
- 金融借款合同纠纷：如果执行和解协议主要涉及的是金融借款合同的履行、变更或解除等事项，且双方争议的焦点仍然围绕金融借款合同展开，那么立案时案由可以确定为金融借款合同纠纷。
- 其他合同纠纷：如果执行和解协议涉及的是其他类型的合同关系，或者虽然与金融借款合同有关，但争议的焦点并非金融借款合同本身，而是和解协议的履行、效力等问题，那么立案时案由可能需要根据具体情况确定为其他合同纠纷。
- 执行异议之诉：如果银行对执行和解协议的效力、履行等提出异议，并因此引发诉讼，那么该诉讼可能属于执行异议之诉的范畴，而非直接的金融借款合同纠纷。
实际操作中的考虑：
- 在实际操作中，法院会根据当事人提交的起诉状、证据材料以及相关法律法规，综合判断当事人之间的法律关系以及争议的焦点，从而确定适当的案由。
法律建议：
- 如果银行作为原告对执行和解协议提起民事诉讼，建议仔细审查执行和解协议的内容以及双方争议的焦点，以便准确确定案由。
- 在准备起诉材料时，应充分阐述双方之间的法律关系、争议焦点以及请求法院裁决的具体事项，以便法院能够准确理解并确定案由。
- 如果对案由的确定存在疑问或不确定，可以咨询专业律师以获取更具体的法律建议。
后续行动指导：
- 在提起诉讼前，建议银行与对方进行充分的沟通协商，尝试通过和解或调解等方式解决争议，以减少诉讼成本和时间。
- 如果协商无果，银行应尽快准备起诉材料并提起诉讼，以免错过诉讼时效或导致其他不利后果。
- 在诉讼过程中，银行应积极配合法院的工作，及时提交证据材料并参加庭审等活动，以便法院能够全面了解案情并作出公正裁决。