民间借贷合同纠纷确实属于案由的一种，具体来说，它属于《民事案件案由规定》中的三级案由“合同、准合同纠纷”项下的具体四级案由“民间借贷纠纷”。以下是对这一问题的详细解析：
一、案由的定义与性质
案由是法院对诉讼案件所涉及的法律关系的性质进行概括后形成的案件名称。在民间借贷合同纠纷中，案由“民间借贷纠纷”直接反映了纠纷的本质，即围绕借款合同的签订、履行、变更、终止等环节产生的争议。这种争议通常涉及借款本金、利息、还款期限、违约责任等多个方面。
二、民间借贷合同纠纷的常见情形
利息支付纠纷：
- 合同中可能未明确约定利息或约定模糊，导致双方对利息计算产生异议。
- 利息约定可能超出法定上限，超出部分法律不予保护。
还款期限纠纷：
- 合同未明确还款时间，出借人可随时要求还款，但借款人可能请求合理准备时间。
- 借款人未按约定期限还款，出借人有权要求承担违约责任。
借款本金认定纠纷：
- 出借人可能在借款时扣除利息后交付本金，但仍按原金额主张，而借款人认为应以实际收到金额为准。
- 双方对借款本金的具体支付方式和金额有不同意见，且缺乏充分证据支持各自主张。
保证责任纠纷：
- 保证合同的有效性、保证方式（一般保证还是连带责任保证）以及保证期间等均可能成为争议点。
- 保证人可能因出借人未在保证期间内主张权利而拒绝承担责任。
三、法律依据与处理原则
处理民间借贷合同纠纷主要依据以下法律法规：
- 《中华人民共和国民法典》：关于合同的一般规定及借款合同的专门条款，为纠纷解决提供基础框架。特别是第六百七十条规定，借款的利息不得预先在本金中扣除，利息预先在本金中扣除的，应当按照实际借款数额返还借款并计算利息。
- 《最高人民法院关于审理民间借贷案件适用法律若干问题的规定》：针对民间借贷的特殊性，对合同成立、效力、利息、还款期限、违约责任等方面作出详细规定。
在处理此类纠纷时，法院将综合考虑合同条款、双方行为、交易习惯及公平原则，确保判决既符合法律规定又兼顾双方合法权益。
四、实际应用指导
面对民间借贷合同纠纷，当事人应：
- 优先协商解决：在争议不大时，双方应尝试通过友好协商达成和解，制定并执行还款计划或调整利息支付方式。
- 寻求第三方调解：若协商无果，可考虑请求人民调解委员会等第三方机构介入调解，以提高解决效率并降低成本。
- 依法提起诉讼：当调解仍无法解决问题时，出借人有权向有管辖权的人民法院提起诉讼。诉讼过程中应准备充分证据，遵循法律程序进行。
总结：民间借贷合同纠纷确实属于案由的一种，且涉及多个方面的争议。在处理此类纠纷时，当事人应充分了解相关法律规定，准备充分的证据，并选择正确的解决方式。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。