关于您提出的“土地承包经营权的确权由哪个部门来做，以及有什么法律依据”的问题，以下是我为您提供的详细解答：
一、土地承包经营权确权的主管部门
土地承包经营权的确权工作主要由农业农村部门（原农业部）负责。这一部门在农村土地承包及承包合同管理方面扮演着关键角色，具体职责包括组织开展土地承包经营权的调查、审核、登记等工作，核实和确认承包地块的面积、四至范围等信息，并颁发土地承包经营权证，以保障农民的土地承包权益。
二、土地承包经营权确权的法律依据
土地承包经营权确权的主要法律依据是《中华人民共和国农村土地承包法》。该法明确规定了农业农村部门在农村土地承包经营及承包经营合同管理方面的职责，为土地承包经营权的确权提供了坚实的法律基础。具体来说，该法第十一条指出：“国务院农业农村、林业和草原主管部门分别依照国务院规定的职责负责全国农村土地承包经营及承包经营合同管理。县级以上地方人民政府农业农村、林业和草原等主管部门分别依照各自职责，负责本行政区域内农村土地承包经营及承包经营合同管理。”这一条款直接赋予了农业农村部门在土地承包经营权确权方面的法定职责。
三、实际操作建议
咨询当地部门：由于地区差异和政策变化，具体的确权流程和要求可能会有所不同。因此，在进行土地承包经营权确权时，建议您先咨询当地政府的农业农村部门，以获取最准确、最权威的信息和指导。
准备相关材料：根据当地部门的要求，准备好相关的土地承包合同、身份证明等材料，以便顺利进行确权登记。
遵循法定程序：在确权过程中，务必遵循法定程序，如参加调查、审核、登记等环节，确保您的土地承包经营权得到合法确认。
综上所述，土地承包经营权的确权工作主要由农业农村部门负责，其法律依据是《中华人民共和国农村土地承包法》。在进行确权时，建议您咨询当地部门、准备相关材料并遵循法定程序，以确保您的土地承包权益得到充分保障。