撤销案件的决定主体主要依据案件的性质、管辖层级以及具体法律情形来确定，一般由作出立案决定的机关或其上级机关决定，并通过决定书、裁定书或判决书等形式体现。以下从不同诉讼类型角度进行详细分析：
一、刑事诉讼中的撤销案件
公安机关侦查的案件
- 适用情形：在刑事侦查过程中，若发现无犯罪事实、犯罪情节显著轻微不需追究刑事责任，或其他依法不追究刑事责任的情形（如犯罪已过追诉时效、经特赦令免除刑罚等），公安机关应撤销案件。
- 决策与文书：撤销案件的决定由县级以上公安机关负责人批准，并制作撤销案件决定书。例如，若公安机关在侦查中发现犯罪嫌疑人并未实施犯罪行为，或者犯罪行为情节显著轻微，不构成犯罪，那么公安机关就会作出撤销案件的决定，并出具相应的决定书。
检察机关侦查的案件
- 适用情形：检察机关在自行侦查或审查起诉过程中，若发现证据不足不符合起诉条件，或犯罪情节轻微不需判处刑罚，可作出不起诉决定，即意味着案件被撤销。
- 决策与文书：检察机关会制作撤销案件决定书或不起诉决定书来体现撤销案件的决定。比如，检察机关在审查起诉阶段，经过仔细审查证据和案情，认为犯罪嫌疑人的行为不构成犯罪，或者犯罪情节轻微，不需要判处刑罚，那么检察机关就会作出不起诉的决定，并出具相应的决定书。
法院审判的案件
- 适用情形：在审判阶段，对于情节显著轻微、危害不大不认为是犯罪的，犯罪已过追诉时效的，经特赦令免除刑罚的，或被告人死亡等情形，法院应裁定终止审理或判决宣告被告人无罪。
- 决策与文书：法院不会单独出具撤销案件决定书，而是通过裁定书或判决书的形式来体现。例如，在审判过程中，法院发现案件存在上述情形之一，就会裁定终止审理或者判决宣告被告人无罪，这实际上也起到了撤销案件的效果。
二、行政诉讼中的撤销案件
- 适用情形：在行政诉讼中，若已立案的行政案件不符合起诉条件，法院会裁定驳回起诉，起到撤销案件的效果。
- 决策与文书：法院会出具裁定书载明裁定结果和理由。比如，原告提起的行政诉讼不符合法律规定的起诉条件，法院在审查后就会裁定驳回起诉，并出具相应的裁定书。
三、民事诉讼中的撤诉
- 适用情形：在民事诉讼中，原告有权申请撤诉。当法院裁定准许时，即实现撤诉效果。
- 决策与文书：法院会出具裁定书载明裁定结果和理由，这与刑事诉讼中的撤销案件决定书性质不同。例如，原告在民事诉讼过程中，由于各种原因决定撤回起诉，向法院提出撤诉申请，法院在审查后认为符合撤诉条件，就会裁定准许撤诉，并出具相应的裁定书。
四、特殊情况
- 监察机关案件：在特定情况下，如省级以下监察机关拟撤销上级监察机关指定管辖或交办案件，需报指定管辖或交办案件的监察机关审查。同意后，下级监察机关才会作出撤销案件决定并制作《撤销案件决定书》。
总结与建议：撤销案件的决定主体和程序因案件性质和法律情形的不同而有所差异。在处理具体案件时，应仔细分析案件性质和法律情形，确定正确的决定主体和程序。如果你面临具体的撤销案件问题，或者对撤销案件的程序和决定主体有疑问，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。