公安机关撤销案件的决定权在于公安机关自身，具体由县级以上公安机关负责人提出并批准。

在刑事侦查过程中，若公安机关经过侦查发现存在以下情形之一，应当撤销案件：

1. 没有犯罪事实的；
2. 情节显著轻微、危害不大，不认为是犯罪的；
3. 犯罪已过追诉时效期限的；
4. 经特赦令免除刑罚的；
5. 犯罪嫌疑人死亡的；
6. 其他依法不追究刑事责任的。

这些情形均属于法定不追究刑事责任的情形，一旦确认存在，公安机关即应撤销案件。撤销案件的决定由县级以上公安机关负责人批准，并制作撤销案件决定书，以体现撤销案件的决定。

综上所述，公安机关撤销案件的决定权在于公安机关自身，并需经过县级以上公安机关负责人的批准。若您对此有更多疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。