结论：针对您提出的“工伤仲裁申请了之后，公司把合同复印件拿过去就是不盖章”的问题，这主要涉及到证据提交和仲裁程序的问题，以下从几个方面为您详细分析并提供建议。

一、合同复印件的法律效力

1. 复印件的证明力：在法律上，合同复印件本身并不具备与原件同等的法律效力，但其可以作为辅助证据使用。如果公司拒绝在复印件上盖章，这并不意味着复印件就完全无效，关键在于其他证据能否佐证复印件的真实性。

2. 其他证据的佐证：您可以尝试收集其他与劳动合同相关的证据，如工资条、工作证、考勤记录、同事证言等，这些证据可以与合同复印件相互印证，增强其证明力。

二、仲裁程序中的证据提交

1. 提交证据的要求：在仲裁程序中，您需要按照仲裁机构的要求提交证据。如果仲裁机构要求提交劳动合同原件，而您只有复印件，您应当向仲裁机构说明情况，并提交其他能够证明劳动关系的证据。

2. 公司的举证责任：如果公司拒绝提供劳动合同原件或拒绝在复印件上盖章，且无法提供其他合理理由，仲裁机构可能会根据《劳动争议调解仲裁法》的相关规定，要求公司承担举证不能的不利后果。

三、针对公司行为的应对策略

1. 与公司沟通：首先，您可以尝试与公司进行沟通，了解公司拒绝盖章的具体原因，并尝试协商解决。如果公司无正当理由拒绝盖章，您可以向其说明法律后果，并要求其配合仲裁程序。

2. 申请仲裁机构调查取证：如果沟通无果，您可以向仲裁机构申请调查取证，要求仲裁机构责令公司提交劳动合同原件或提供其他相关证据。仲裁机构有权根据案件需要，向有关单位和个人调查取证。

3. 寻求法律援助：如果您在处理此事过程中遇到困难，可以寻求法律援助或咨询专业律师（即向我咨询），以获取更具体的法律建议和帮助。

四、可能的法律后果

1. 对公司的影响：如果公司无正当理由拒绝提供劳动合同原件或拒绝在复印件上盖章，且无法提供其他合理理由，仲裁机构可能会认定公司存在过错，并据此作出对公司不利的裁决。

2. 对您的权益保护：通过合法途径维护自己的权益，您有望获得应有的工伤赔偿和其他相关权益。如果仲裁结果不满意，您还可以依法向人民法院提起诉讼。

建议：在处理此类问题时，请务必保持冷静和理性，按照法律程序和规定进行操作。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。我会根据您的具体情况，为您提供更详细和专业的法律建议。