结论：在侵权作者罪的案件中，即使检察院阶段拿到了谅解书，法院是否会传对方公司出来作证，并非一个确定的结果，而是取决于案件的具体情况和法院的判断。以下从多个角度进行分析：

1. 谅解书的作用与影响：

   • 谅解书是犯罪嫌疑人或被告人与被害人或其家属之间达成的一种和解协议，通常表明被害人或其家属对犯罪嫌疑人或被告人的行为表示谅解，并可能请求司法机关从轻或减轻处罚。
   • 在知识产权侵权案件中，谅解书可能涉及赔偿金额、道歉方式、未来合作等条款，但它并不直接决定法院是否会传对方公司作证。

2. 法院传证的原则与考量：

   • 法院在审理案件时，会根据案件的需要和证据的充分性来决定是否传唤证人出庭作证。
   • 如果对方公司（即被侵权方）的证言对于查明案件事实、确定侵权责任等具有关键作用，且法院认为有必要听取其意见，那么法院很可能会传唤对方公司出庭作证。
   • 另一方面，如果案件事实已经通过其他证据（如书面证据、专家鉴定等）得到充分证明，或者对方公司的证言对于案件结果影响不大，那么法院可能不会传唤其出庭。

3. 谅解书与传证之间的关联：

   • 谅解书的存在并不直接排除法院传唤对方公司作证的可能性。即使双方已经达成和解，法院仍可能为了确保案件的公正审理和事实的准确查明而传唤关键证人。
   • 同时，谅解书也可能在一定程度上影响法院对证人证言的采信程度。如果谅解书中包含了对方公司对犯罪嫌疑人或被告人的某种程度的谅解或宽容，这可能在法院评估证人证言时起到一定的参考作用。

4. 实际操作中的建议：

   • 对于犯罪嫌疑人或被告人而言，即使拿到了谅解书，也不应忽视法院可能传唤对方公司作证的可能性。应做好充分的准备，包括了解对方公司的证言内容、准备反驳证据等。
   • 对于被侵权方（即对方公司）而言，如果收到法院的传票要求出庭作证，应积极配合法院的工作，如实提供证言，并准备好相关证据以支持自己的主张。

总结与进一步建议：在侵权作者罪的案件中，谅解书的存在并不直接决定法院是否会传对方公司出庭作证。法院会根据案件的具体情况和证据的充分性来做出判断。因此，无论您是犯罪嫌疑人/被告人还是被侵权方，都应做好充分的准备以应对可能的法庭传唤。如果您有任何具体的法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。