如果政府机关单位员工被借调但本人不同意，一般情况下，员工有权拒绝借调。以下是从不同角度对此问题的详细分析：
一、借调的合法性与员工权益
借调通常指的是因工作需要，将员工从原单位暂时借用到其他单位工作，但员工的劳动关系仍保留在原单位。在大多数情况下，借调需要员工的同意，因为这涉及到员工的工作地点、工作内容等劳动条件的变更。如果员工不同意借调，原单位通常不能强制要求员工接受。
二、员工拒绝借调的法律依据
- 劳动合同的约定：如果劳动合同中明确规定了员工的工作地点、工作内容等，且没有约定可以借调或变更这些条件，那么员工有权拒绝借调。因为借调可能构成对劳动合同的变更，需要双方协商一致。
- 劳动法的保护：根据《中华人民共和国劳动法》的相关规定，员工有权拒绝用人单位提出的违法或不合理的要求。如果借调违反了劳动法的规定，如未经员工同意擅自变更工作地点、工作内容等，员工有权拒绝。
三、员工拒绝借调的可能后果
- 原单位可能采取的措施：虽然员工有权拒绝借调，但原单位可能会根据内部规章制度或劳动合同的约定，采取一些措施，如调整员工的工作岗位、降低薪资等。然而，这些措施也必须合法合规，不能侵犯员工的合法权益。
- 员工应如何应对：如果员工拒绝借调后，原单位采取了不合理的措施，员工可以通过与原单位协商、向劳动监察部门投诉、申请劳动仲裁等方式来维护自己的合法权益。
四、特殊情况下的借调
在某些特殊情况下，如政府机关因紧急任务需要借调员工，且这种借调是出于公共利益的需要，可能会存在一定的强制性。但即便如此，原单位也应尽量与员工协商，争取员工的理解和支持。如果员工仍然不同意，原单位应考虑其他解决方案，而不是强制借调。
五、建议与总结
- 对于员工：如果收到借调通知但不同意，建议首先与原单位进行沟通，明确表达自己的意愿和理由。如果沟通无果，可以寻求法律援助或咨询专业律师，了解自己的权益和可能的维权途径。
- 对于原单位：在借调员工前，应充分与员工沟通，了解员工的意愿和实际情况。如果员工不同意借调，应尊重员工的意愿，并考虑其他解决方案。
总结来说，员工在不同意借调的情况下，有权拒绝借调。如果原单位因此采取不合理措施，员工可以通过合法途径维护自己的权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。