在职员工在合法权益受到公司侵害时，确实有权依法起诉公司，但需遵循一定的法律程序和条件。以下是从不同角度对这一问题的详细分析：
一、起诉的法律依据与条件
根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》和《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，劳动者在其合法权益受到侵害时，有权要求有关部门依法处理，或依法申请仲裁、提起诉讼。具体起诉条件包括：
- 原告资格：在职员工作为原告，需与所诉事项有直接利害关系。
- 明确的被告：被告即为员工所在的公司。
- 具体的诉讼请求和事实、理由：员工需明确诉讼请求，并提供相关事实和理由来支持其主张。
- 受理范围：所诉事项需属于民事诉讼的受理范围，并选择正确的人民法院进行起诉。
二、劳动纠纷方面的起诉情形
在职员工可能因以下劳动纠纷情形起诉公司：
- 未足额支付劳动报酬：若公司存在克扣工资、不按劳动合同约定发放工资或拖欠加班工资等情况，员工可起诉要求补足工资差额及支付赔偿金。
- 未依法缴纳社会保险：公司需按时、足额为员工缴纳社保。若未履行此义务，导致员工无法享受社保待遇，员工可起诉要求补缴社保并赔偿损失。
- 违法解除或终止劳动合同：公司无正当理由辞退员工或在不符合法定条件下解除劳动合同，员工可起诉要求支付赔偿金，通常为经济补偿标准的二倍。
三、人身权益及其他方面的起诉情形
除了劳动纠纷，在职员工还可能因以下人身权益或其他方面的纠纷起诉公司：
- 工作场所受伤未妥善处理：员工在工作过程中遭受工伤，若公司未按法律规定处理，员工可起诉维护自己获得合理赔偿的权利。
- 职场性骚扰等侵权行为：若员工遭受公司内部人员的性骚扰等侵权行为，且公司未采取有效措施处理，员工可起诉要求承担侵权责任。
- 侵害知识产权：员工的发明创造、作品等知识产权被公司非法占有或侵犯时，可起诉要求停止侵权并给予赔偿。
四、起诉前的准备与流程
在决定起诉前，员工应做好以下准备并遵循相应流程：
- 协商与调解：尝试通过协商、调解等方式解决劳动争议。依据《中华人民共和国劳动法》，劳动争议发生后，可向劳动争议调解委员会申请调解。
- 劳动仲裁：对于劳动争议案件，员工在起诉前必须先经过劳动仲裁程序。即先向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，对仲裁裁决不服的，方可向人民法院提起诉讼。
- 证据收集：证据的收集至关重要。员工需准备与公司存在劳动关系的证明材料（如劳动合同、工资单、工作证明等），以及支持自己诉讼请求的相关证据（如公司违法行为的证据、损害事实的证据等）。
五、起诉的程序与注意事项
在起诉过程中，员工需注意以下程序与事项：
- 起诉程序：根据《中华人民共和国民事诉讼法》，员工需向人民法院递交起诉状，并按被告人数提出副本。如书写起诉状确有困难，可口头起诉，由人民法院记入笔录，并告知对方当事人。
- 时效问题：劳动争议申请仲裁的时效期间为一年，从当事人知道或应当知道其权利被侵害之日起计算。员工应在此时效期内提起仲裁申请，否则可能因超过时效而丧失权利。
- 潜在影响：虽然法律诉讼是解决争议的一种手段，但也可能对工作环境和职业发展产生影响。因此，在决定采取法律行动前，员工应慎重考虑并寻求专业法律意见。
综上所述，在职员工在合法权益受到公司侵害时，有权依法起诉公司，但需遵循一定的法律程序和条件。如果你有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。