三班两倒的工作制度下，劳动者是否有加班费，主要取决于其实际工作时间是否超出了法定标准工作时间，以及是否在休息日或法定节假日工作且未获得补休。 以下是对这一问题的详细分析：

一、法定标准工作时间与加班认定

1. 法定标准工作时间：

   • 根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，劳动者每日工作时间不超过8小时，每周工作时间不超过40小时（或平均每周不超过44小时，具体依据地方规定可能略有差异）。这是判断是否加班的基本标准。

2. 加班的认定：

   • 若三班两倒的工作制度导致劳动者每日工作时间超过8小时，或每周工作时间超过40小时，则超出部分应认定为加班。
   • 若在休息日（如周六、周日）或法定节假日（如元旦、春节等）工作，且未获得补休，也应认定为加班。

二、加班费的支付标准

1. 延长工作时间的加班费：

   • 法律依据：根据《中华人民共和国劳动法》第四十四条，安排劳动者延长工作时间的，应支付不低于工资的百分之一百五十的工资报酬。
   • 计算方式：加班费 = 小时工资 × 1.5 × 延长工作小时数。其中，小时工资 = 月工资收入 ÷（月计薪天数 × 8小时），月计薪天数一般按21.75天计算。

2. 休息日加班费：

   • 法律依据：同上，休息日安排劳动者工作又不能安排补休的，应支付不低于工资的百分之二百的工资报酬。
   • 计算方式：加班费 = 小时工资 × 2 × 休息日工作小时数。

3. 法定节假日加班费：

   • 法律依据：同上，法定休假日安排劳动者工作的，应支付不低于工资的百分之三百的工资报酬。
   • 计算方式：加班费 = 小时工资 × 3 × 法定节假日工作小时数。

三、实际应用中的注意事项

1. 准确记录出勤情况：

   • 用人单位应严格记录员工的出勤情况，包括具体的工作时间、班次等，以便准确计算加班费。

2. 遵守劳动合同约定：

   • 在计算加班费时，还需注意劳动合同中是否有关于加班费的特别约定，并确保这些约定符合当地的法律法规。

3. 加班工资计算基数的确定：

   • 劳动合同对工资有明确约定的，按约定执行；无明确约定的，按集体合同约定执行；用人单位与劳动者无任何约定的，按劳动者本人所在岗位正常出勤的月工资确定。

四、举例说明

假设某劳动者月工资为5000元，采用三班两倒的工作制度，某周工作了48小时（其中包含一个休息日8小时），且未获得补休。则：

• 延长工作时间加班费：

  • 延长工作时间 = 48小时 - 40小时（法定标准工作时间）= 8小时
  • 加班费 = （5000元 ÷ 21.75天 ÷ 8小时）× 1.5 × 8小时 ≈ 344.83元

• 休息日加班费：

  • 休息日加班 = 8小时
  • 加班费 = （5000元 ÷ 21.75天 ÷ 8小时）× 2 × 8小时 ≈ 459.77元

• 总加班费：

  • 总加班费 = 延长工作时间加班费 + 休息日加班费 ≈ 344.83元 + 459.77元 = 804.60元

综上所述，三班两倒的工作制度下，劳动者是否有加班费取决于其实际工作时间是否超出了法定标准工作时间，以及是否在休息日或法定节假日工作且未获得补休。 若存在加班情况，用人单位应依法支付加班费。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。