法院判决确认房屋补偿决定程序违法，这一判决在符合法定情形时是正确的。以下从多个角度对此问题进行分析：
一、程序违法的常见情形及法律依据
在拆迁补偿过程中，程序合法是保障被征收人合法权益的关键。根据相关法律法规及实践，程序违法常见情形包括但不限于：
未进行合法评估或评估不公正：
- 法律规定，房屋价值应由具有资质的评估机构按法定程序评估确定。若评估机构选定不合法、评估方法不合理、评估报告未送达或存在其他不公正情况，均属程序违法。
侵犯知情权、参与权和申辩权：
- 拆迁方需在作出补偿决定前公告征收补偿方案，征求意见不少于30日，并组织听证会。未进行公告、征求意见、组织听证或未按规定期限进行，均剥夺了被征收人的合法权益。
补偿决定主体和时间不符合规定：
- 拆迁补偿决定应由市、县级人民政府作出，且在签约期限内达不成协议或被征收房屋所有权人不明确时才能作出。非法定主体作出或提前作出补偿决定，均为违法。
缺乏有效拆迁许可证书：
- 拆迁方在未取得合法拆迁许可的情况下进行拆迁，属于严重的程序违法。
安置通知不到位或未进行社会稳定风险评估：
- 拆迁方需向被拆迁人提供合理的安置方案或通知，且应在拆迁前进行社会稳定风险评估。未履行这些义务，同样构成程序违法。
法律依据：
- 《中华人民共和国行政诉讼法》第七十条：行政行为有下列情形之一的，人民法院判决撤销或者部分撤销，并可以判决被告重新作出行政行为：……（三）违反法定程序的；……
二、程序违法的法律后果
若法院判决确认房屋补偿决定程序违法，将产生以下法律后果：
损害被征收人合法权益：
- 程序违法直接导致被征收人可能无法获得应有的补偿和安置，严重损害其合法权益。
可申请行政复议或提起行政诉讼：
- 被征收人可在知道具体行政行为之日起60日内申请行政复议，或在知道或应当知道作出行政行为之日起6个月内提起行政诉讼，要求撤销违法的拆迁补偿决定。
影响拆迁项目合法性和进度：
- 一旦拆迁补偿决定被认定程序违法，整个拆迁项目可能暂停，拆迁方需重新按法定程序操作，增加成本和时间。
引发社会不满和矛盾，影响政府公信力：
- 程序违法易引发被征收人的不满和抵触情绪，甚至导致社会矛盾和冲突，同时损害政府的公信力和形象。
三、被征收人的应对措施
面对房屋补偿决定程序违法的情况，被征收人可以采取以下措施：
及时收集证据：
- 被征收人应收集与拆迁相关的各种证据，如征收公告、补偿方案、评估报告、沟通记录等，为后续维权提供有力支持。
申请行政复议或提起行政诉讼：
- 在法定期限内，通过法律途径申请行政复议或提起行政诉讼，要求撤销违法的拆迁补偿决定，并寻求合理的补偿和安置。
申请国家赔偿：
- 因拆迁程序违法给被征收人造成财产损失的，有权依据《中华人民共和国国家赔偿法》向责任机构申请国家赔偿。
四、结论
综上所述，法院判决确认房屋补偿决定程序违法，在符合法定情形时是正确的。这一判决不仅维护了被征收人的合法权益，也促进了拆迁工作的合法性和公正性。若您面临类似情况，建议及时收集证据，并在法定期限内申请行政复议或提起行政诉讼，以维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。