针对您提出的“国企职工不起诉单位怎么处理”的问题，这确实是一个涉及法律、纪律和单位内部管理多个层面的复杂问题。以下是我为您提供的详细解答：
首先，我们需要明确“不起诉”的含义。不起诉是指人民检察院对案件进行审查后，认为不具备起诉条件或没有必要起诉，依法不将案件移送人民法院进行审判而终止诉讼的特别程序。在国企职工的情境中，这通常意味着职工因某种原因（如犯罪情节轻微、证据不足等）未被检察机关提起公诉。
接下来，我们根据不起诉的不同情形来分析国企应如何处理：
法定不起诉：
- 当检察机关认为职工的行为不构成犯罪或依法不应追究刑事责任时，会作出法定不起诉决定。
- 在这种情况下，国企通常不能直接依据《劳动法》第二十五条第(四)项（职工被依法追究刑事责任的，用人单位可以解除其劳动合同）来解除与职工的劳动合同。
- 国企应依据单位内部规章制度、劳动合同以及相关法律法规，对职工进行其他形式的处理，如警告、记过、降职、撤职等，或者根据具体情况决定是否继续留用。
酌定不起诉：
- 酌定不起诉是检察机关认为职工犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或者可以免除刑罚时作出的决定。
- 对于此类不起诉的职工，国企同样不能直接解除劳动合同，但可以根据职工的具体行为、性质、情节以及单位内部规章制度，给予相应的纪律处分。
- 如果职工的行为同时违反了党纪或公职人员政务处分规定，国企还应配合纪检监察机关进行相应的党纪政务处分。
存疑不起诉：
- 存疑不起诉是检察机关因证据不足或存在非法取证行为而作出的不起诉决定。
- 在这种情况下，国企应谨慎处理，因为虽然职工未被检察机关提起公诉，但并不意味着其没有违纪违法行为。
- 国企应配合纪检监察机关对职工的行为进行进一步调查，根据调查结果和单位内部规章制度给予相应的处理。
此外，国企在处理不起诉职工时，还应考虑以下因素：
- 职工的个人表现：包括工作态度、工作能力、过往表现等，这些因素可能影响单位对职工的处理决定。
- 单位内部规章制度：国企应依据自身制定的规章制度来处理职工，确保处理决定的合法性和合理性。
- 法律法规的遵循：国企在处理职工时，必须严格遵守国家法律法规，不得侵犯职工的合法权益。
综上所述，国企在处理不起诉职工时，应根据不起诉的具体情形、职工的个人表现、单位内部规章制度以及法律法规的遵循等多个因素进行综合考量，作出合法、合理、公正的处理决定。如果职工对处理决定有异议，可以通过合法途径进行申诉或维权。