原被告达成调解协议后，确实可以由法院调解结案。以下是对这一问题的详细分析：

一、调解结案的法律依据

根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，人民法院审理民事案件，根据当事人自愿的原则，在事实清楚的基础上，分清是非，进行调解。调解达成协议，人民法院应当制作调解书。调解书应当写明诉讼请求、案件的事实和调解结果，并由审判人员、书记员署名，加盖人民法院印章，送达双方当事人。调解书经双方当事人签收后，即具有法律效力，案件即视为调解结案。

二、调解结案的具体流程

1. 达成调解协议：在诉讼过程中，原被告双方在法院的主持下，通过协商达成一致意见，形成调解协议。
2. 制作调解书：法院根据调解协议的内容，制作调解书。调解书应明确记载诉讼请求、案件事实和调解结果。
3. 签收调解书：调解书制作完成后，法院会将其送达双方当事人。双方当事人在签收调解书后，即表示接受调解结果。
4. 调解书生效：调解书经双方当事人签收后，即具有法律效力。此时，案件即视为调解结案，法院不再对案件进行进一步的审理和判决。

三、调解结案的注意事项

1. 自愿原则：调解结案必须基于双方当事人的自愿原则。任何一方不得强迫对方接受调解结果。
2. 事实清楚、分清是非：法院在调解过程中，应确保案件事实清楚，分清是非责任。这有助于双方当事人达成公平合理的调解协议。
3. 调解书的法律效力：调解书一旦签收，即具有法律效力。双方当事人应严格遵守调解书的内容，不得擅自变更或解除。
4. 调解不成的情况：如果双方当事人在调解过程中无法达成一致意见，或者一方当事人拒绝签收调解书，那么法院将依法对案件进行审理并作出判决。

四、调解结案的优势

1. 节省时间和成本：与诉讼相比，调解结案通常更加迅速，能够节省双方当事人的时间和诉讼成本。
2. 维护双方关系：调解结案有助于维护双方当事人之间的和谐关系，避免因诉讼而产生的对立和冲突。
3. 灵活性和自主性：调解结案允许双方当事人在法院的主持下自主协商，达成符合双方利益的调解协议。

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